Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930513O06RikQ9D549 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
4930513O06RikQ9D549 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
4930513O06RikQ9D549 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930513O06RikQ9D549 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930513O06RikQ9D549 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930513O06RikQ9D549 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
4930513O06RikQ9D549 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
4930513O06RikQ9D549 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
4930513O06RikQ9D549 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4930513O06RikQ9D549 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
4930513O06RikQ9D549 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
4930513O06RikQ9D549 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
4930513O06RikQ9D549 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
4930513O06RikQ9D549 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
4930513O06RikQ9D549 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930513O06RikQ9D549 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
4930513O06RikQ9D549 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930513O06RikQ9D549 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
4930513O06RikQ9D549 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
4930513O06RikQ9D549 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930513O06RikQ9D549 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930513O06RikQ9D549 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
4930513O06RikQ9D549 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
4930513O06RikQ9D549 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
4930513O06RikQ9D549 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
4930513O06RikQ9D549 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
4930513O06RikQ9D549 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930513O06RikQ9D549 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930513O06RikQ9D549 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930513O06RikQ9D549 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930513O06RikQ9D549 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
4930513O06RikQ9D549 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930513O06RikQ9D549 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4930513O06RikQ9D549 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930513O06RikQ9D549 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930513O06RikQ9D549 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930513O06RikQ9D549 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930513O06RikQ9D549 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
4930513O06RikQ9D549 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
4930513O06RikQ9D549 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930513O06RikQ9D549 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930513O06RikQ9D549 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930513O06RikQ9D549 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
4930513O06RikQ9D549 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930513O06RikQ9D549 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
4930513O06RikQ9D549 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
4930513O06RikQ9D549 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
4930513O06RikQ9D549 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
4930513O06RikQ9D549 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
4930513O06RikQ9D549 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
4930513O06RikQ9D549 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4930513O06RikQ9D549 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
4930513O06RikQ9D549 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
4930513O06RikQ9D549 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4930513O06RikQ9D549 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4930513O06RikQ9D549 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
4930513O06RikQ9D549 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
4930513O06RikQ9D549 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
4930513O06RikQ9D549 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
4930513O06RikQ9D549 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
4930513O06RikQ9D549 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4930513O06RikQ9D549 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
4930513O06RikQ9D549 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
4930513O06RikQ9D549 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4930513O06RikQ9D549 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930513O06RikQ9D549 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
4930513O06RikQ9D549 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4930513O06RikQ9D549 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4930513O06RikQ9D549 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4930513O06RikQ9D549 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930513O06RikQ9D549 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930513O06RikQ9D549 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930513O06RikQ9D549 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930513O06RikQ9D549 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930513O06RikQ9D549 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
4930513O06RikQ9D549 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930513O06RikQ9D549 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930513O06RikQ9D549 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930513O06RikQ9D549 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930513O06RikQ9D549 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930513O06RikQ9D549 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
4930513O06RikQ9D549 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930513O06RikQ9D549 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930513O06RikQ9D549 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930513O06RikQ9D549 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930513O06RikQ9D549 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930513O06RikQ9D549 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930513O06RikQ9D549 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930513O06RikQ9D549 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930513O06RikQ9D549 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
4930513O06RikQ9D549 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930513O06RikQ9D549 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930513O06RikQ9D549 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930513O06RikQ9D549 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930513O06RikQ9D549 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930513O06RikQ9D549 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930513O06RikQ9D549 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930513O06RikQ9D549 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
4930513O06RikQ9D549 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms