Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Tmed11Q9D2R4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Tmed11Q9D2R4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Tmed11Q9D2R4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Tmed11Q9D2R4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Tmed11Q9D2R4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23,4■■□□□ 1,34
Tmed11Q9D2R4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
Tmed11Q9D2R4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Tmed11Q9D2R4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Tmed11Q9D2R4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23,35■■□□□ 1,33
Tmed11Q9D2R4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Tmed11Q9D2R4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Tmed11Q9D2R4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Tmed11Q9D2R4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23,3■■□□□ 1,32
Tmed11Q9D2R4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Tmed11Q9D2R4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Tmed11Q9D2R4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23,29■■□□□ 1,32
Tmed11Q9D2R4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Tmed11Q9D2R4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Tmed11Q9D2R4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Tmed11Q9D2R4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Tmed11Q9D2R4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Tmed11Q9D2R4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Tmed11Q9D2R4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Tmed11Q9D2R4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Tmed11Q9D2R4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Tmed11Q9D2R4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Tmed11Q9D2R4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Tmed11Q9D2R4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Tmed11Q9D2R4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,21■■□□□ 1,31
Tmed11Q9D2R4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Tmed11Q9D2R4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Tmed11Q9D2R4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23,19■■□□□ 1,3
Tmed11Q9D2R4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23,18■■□□□ 1,3
Tmed11Q9D2R4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Tmed11Q9D2R4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Tmed11Q9D2R4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Tmed11Q9D2R4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Tmed11Q9D2R4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,15■■□□□ 1,3
Tmed11Q9D2R4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
Tmed11Q9D2R4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Tmed11Q9D2R4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Tmed11Q9D2R4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Tmed11Q9D2R4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23,09■■□□□ 1,29
Tmed11Q9D2R4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Tmed11Q9D2R4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Tmed11Q9D2R4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Tmed11Q9D2R4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Tmed11Q9D2R4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Tmed11Q9D2R4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Tmed11Q9D2R4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Tmed11Q9D2R4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23,05■■□□□ 1,28
Tmed11Q9D2R4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Tmed11Q9D2R4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Tmed11Q9D2R4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Tmed11Q9D2R4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Tmed11Q9D2R4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Tmed11Q9D2R4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Tmed11Q9D2R4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Tmed11Q9D2R4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23,01■■□□□ 1,27
Tmed11Q9D2R4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Tmed11Q9D2R4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Tmed11Q9D2R4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Tmed11Q9D2R4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22,96■■□□□ 1,27
Tmed11Q9D2R4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Tmed11Q9D2R4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Tmed11Q9D2R4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22,95■■□□□ 1,26
Tmed11Q9D2R4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Tmed11Q9D2R4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22,93■■□□□ 1,26
Tmed11Q9D2R4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Tmed11Q9D2R4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Tmed11Q9D2R4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Tmed11Q9D2R4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Tmed11Q9D2R4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Tmed11Q9D2R4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,91■■□□□ 1,26
Tmed11Q9D2R4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22,9■■□□□ 1,26
Tmed11Q9D2R4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
Tmed11Q9D2R4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,89■■□□□ 1,25
Tmed11Q9D2R4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22,89■■□□□ 1,25
Tmed11Q9D2R4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Tmed11Q9D2R4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Tmed11Q9D2R4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Tmed11Q9D2R4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Tmed11Q9D2R4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Tmed11Q9D2R4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22,84■■□□□ 1,25
Tmed11Q9D2R4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22,84■■□□□ 1,25
Tmed11Q9D2R4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Tmed11Q9D2R4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,24
Tmed11Q9D2R4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22,83■■□□□ 1,24
Tmed11Q9D2R4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22,81■■□□□ 1,24
Tmed11Q9D2R4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Tmed11Q9D2R4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Tmed11Q9D2R4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22,8■■□□□ 1,24
Tmed11Q9D2R4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,8■■□□□ 1,24
Tmed11Q9D2R4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,8■■□□□ 1,24
Tmed11Q9D2R4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Tmed11Q9D2R4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,79■■□□□ 1,24
Tmed11Q9D2R4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Tmed11Q9D2R4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Tmed11Q9D2R4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38,1 ms