Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmed11Q9D2R4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tmed11Q9D2R4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmed11Q9D2R4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tmed11Q9D2R4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmed11Q9D2R4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmed11Q9D2R4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tmed11Q9D2R4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmed11Q9D2R4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmed11Q9D2R4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmed11Q9D2R4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmed11Q9D2R4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmed11Q9D2R4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmed11Q9D2R4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmed11Q9D2R4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmed11Q9D2R4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmed11Q9D2R4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmed11Q9D2R4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmed11Q9D2R4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmed11Q9D2R4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmed11Q9D2R4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmed11Q9D2R4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmed11Q9D2R4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmed11Q9D2R4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmed11Q9D2R4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmed11Q9D2R4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmed11Q9D2R4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmed11Q9D2R4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmed11Q9D2R4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmed11Q9D2R4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmed11Q9D2R4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmed11Q9D2R4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmed11Q9D2R4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmed11Q9D2R4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmed11Q9D2R4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmed11Q9D2R4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmed11Q9D2R4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmed11Q9D2R4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmed11Q9D2R4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmed11Q9D2R4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmed11Q9D2R4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmed11Q9D2R4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmed11Q9D2R4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmed11Q9D2R4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmed11Q9D2R4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmed11Q9D2R4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmed11Q9D2R4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmed11Q9D2R4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmed11Q9D2R4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmed11Q9D2R4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmed11Q9D2R4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmed11Q9D2R4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmed11Q9D2R4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmed11Q9D2R4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmed11Q9D2R4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmed11Q9D2R4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmed11Q9D2R4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmed11Q9D2R4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmed11Q9D2R4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmed11Q9D2R4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmed11Q9D2R4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmed11Q9D2R4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmed11Q9D2R4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmed11Q9D2R4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmed11Q9D2R4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmed11Q9D2R4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmed11Q9D2R4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmed11Q9D2R4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmed11Q9D2R4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmed11Q9D2R4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmed11Q9D2R4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmed11Q9D2R4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmed11Q9D2R4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmed11Q9D2R4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmed11Q9D2R4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmed11Q9D2R4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmed11Q9D2R4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmed11Q9D2R4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmed11Q9D2R4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmed11Q9D2R4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmed11Q9D2R4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmed11Q9D2R4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmed11Q9D2R4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmed11Q9D2R4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmed11Q9D2R4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmed11Q9D2R4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmed11Q9D2R4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmed11Q9D2R4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmed11Q9D2R4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmed11Q9D2R4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmed11Q9D2R4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmed11Q9D2R4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmed11Q9D2R4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmed11Q9D2R4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmed11Q9D2R4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmed11Q9D2R4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmed11Q9D2R4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmed11Q9D2R4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmed11Q9D2R4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmed11Q9D2R4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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