Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem53Q9D0Z3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem53Q9D0Z3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmem53Q9D0Z3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmem53Q9D0Z3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmem53Q9D0Z3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem53Q9D0Z3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem53Q9D0Z3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tmem53Q9D0Z3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmem53Q9D0Z3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tmem53Q9D0Z3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tmem53Q9D0Z3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tmem53Q9D0Z3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmem53Q9D0Z3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem53Q9D0Z3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tmem53Q9D0Z3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tmem53Q9D0Z3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem53Q9D0Z3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tmem53Q9D0Z3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem53Q9D0Z3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem53Q9D0Z3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem53Q9D0Z3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tmem53Q9D0Z3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem53Q9D0Z3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem53Q9D0Z3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tmem53Q9D0Z3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmem53Q9D0Z3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem53Q9D0Z3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmem53Q9D0Z3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tmem53Q9D0Z3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmem53Q9D0Z3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmem53Q9D0Z3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem53Q9D0Z3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmem53Q9D0Z3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem53Q9D0Z3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmem53Q9D0Z3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmem53Q9D0Z3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmem53Q9D0Z3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmem53Q9D0Z3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem53Q9D0Z3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem53Q9D0Z3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmem53Q9D0Z3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmem53Q9D0Z3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmem53Q9D0Z3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmem53Q9D0Z3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmem53Q9D0Z3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmem53Q9D0Z3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem53Q9D0Z3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmem53Q9D0Z3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmem53Q9D0Z3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem53Q9D0Z3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem53Q9D0Z3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem53Q9D0Z3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem53Q9D0Z3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem53Q9D0Z3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem53Q9D0Z3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem53Q9D0Z3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem53Q9D0Z3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem53Q9D0Z3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem53Q9D0Z3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem53Q9D0Z3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem53Q9D0Z3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem53Q9D0Z3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem53Q9D0Z3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem53Q9D0Z3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem53Q9D0Z3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem53Q9D0Z3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem53Q9D0Z3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem53Q9D0Z3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem53Q9D0Z3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem53Q9D0Z3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem53Q9D0Z3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem53Q9D0Z3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem53Q9D0Z3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem53Q9D0Z3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmem53Q9D0Z3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem53Q9D0Z3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem53Q9D0Z3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem53Q9D0Z3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem53Q9D0Z3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem53Q9D0Z3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem53Q9D0Z3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem53Q9D0Z3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem53Q9D0Z3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem53Q9D0Z3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem53Q9D0Z3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem53Q9D0Z3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem53Q9D0Z3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem53Q9D0Z3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem53Q9D0Z3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem53Q9D0Z3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem53Q9D0Z3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem53Q9D0Z3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem53Q9D0Z3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem53Q9D0Z3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem53Q9D0Z3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem53Q9D0Z3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem53Q9D0Z3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms