Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F3

Lman1, Protein ERGIC-53, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lman1Q9D0F3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Lman1Q9D0F3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,6■■■□□ 2,17
Lman1Q9D0F3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Lman1Q9D0F3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Lman1Q9D0F3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Lman1Q9D0F3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Lman1Q9D0F3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Lman1Q9D0F3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Lman1Q9D0F3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Lman1Q9D0F3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,52■■■□□ 2,16
Lman1Q9D0F3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Lman1Q9D0F3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Lman1Q9D0F3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Lman1Q9D0F3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Lman1Q9D0F3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Lman1Q9D0F3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Lman1Q9D0F3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Lman1Q9D0F3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,47■■■□□ 2,15
Lman1Q9D0F3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Lman1Q9D0F3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Lman1Q9D0F3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Lman1Q9D0F3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Lman1Q9D0F3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Lman1Q9D0F3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Lman1Q9D0F3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Lman1Q9D0F3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Lman1Q9D0F3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Lman1Q9D0F3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Lman1Q9D0F3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Lman1Q9D0F3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Lman1Q9D0F3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Lman1Q9D0F3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Lman1Q9D0F3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,35■■■□□ 2,13
Lman1Q9D0F3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Lman1Q9D0F3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Lman1Q9D0F3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Lman1Q9D0F3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Lman1Q9D0F3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Lman1Q9D0F3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Lman1Q9D0F3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Lman1Q9D0F3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Lman1Q9D0F3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Lman1Q9D0F3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Lman1Q9D0F3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Lman1Q9D0F3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Lman1Q9D0F3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Lman1Q9D0F3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Lman1Q9D0F3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Lman1Q9D0F3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Lman1Q9D0F3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Lman1Q9D0F3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Lman1Q9D0F3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Lman1Q9D0F3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Lman1Q9D0F3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28,08■■■□□ 2,09
Lman1Q9D0F3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Lman1Q9D0F3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Lman1Q9D0F3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Lman1Q9D0F3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,03■■■□□ 2,08
Lman1Q9D0F3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Lman1Q9D0F3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Lman1Q9D0F3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Lman1Q9D0F3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Lman1Q9D0F3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Lman1Q9D0F3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Lman1Q9D0F3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28■■■□□ 2,07
Lman1Q9D0F3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Lman1Q9D0F3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27,99■■■□□ 2,07
Lman1Q9D0F3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Lman1Q9D0F3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Lman1Q9D0F3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27,96■■■□□ 2,07
Lman1Q9D0F3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Lman1Q9D0F3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Lman1Q9D0F3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27,92■■■□□ 2,06
Lman1Q9D0F3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Lman1Q9D0F3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Lman1Q9D0F3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Lman1Q9D0F3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Lman1Q9D0F3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Lman1Q9D0F3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Lman1Q9D0F3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Lman1Q9D0F3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Lman1Q9D0F3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Lman1Q9D0F3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Lman1Q9D0F3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Lman1Q9D0F3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Lman1Q9D0F3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Lman1Q9D0F3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Lman1Q9D0F3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,78■■■□□ 2,04
Lman1Q9D0F3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27,77■■■□□ 2,04
Lman1Q9D0F3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Lman1Q9D0F3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27,76■■■□□ 2,03
Lman1Q9D0F3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27,76■■■□□ 2,03
Lman1Q9D0F3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Lman1Q9D0F3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Lman1Q9D0F3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Lman1Q9D0F3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Lman1Q9D0F3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Lman1Q9D0F3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Lman1Q9D0F3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Lman1Q9D0F3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms