Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXS4

Cenpv, Centromere protein V, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpvQ9CXS4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CenpvQ9CXS4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpvQ9CXS4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpvQ9CXS4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpvQ9CXS4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpvQ9CXS4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CenpvQ9CXS4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpvQ9CXS4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpvQ9CXS4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpvQ9CXS4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CenpvQ9CXS4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CenpvQ9CXS4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpvQ9CXS4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CenpvQ9CXS4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CenpvQ9CXS4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CenpvQ9CXS4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpvQ9CXS4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpvQ9CXS4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CenpvQ9CXS4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpvQ9CXS4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpvQ9CXS4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpvQ9CXS4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpvQ9CXS4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpvQ9CXS4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpvQ9CXS4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpvQ9CXS4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CenpvQ9CXS4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CenpvQ9CXS4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CenpvQ9CXS4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CenpvQ9CXS4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CenpvQ9CXS4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CenpvQ9CXS4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CenpvQ9CXS4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CenpvQ9CXS4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CenpvQ9CXS4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CenpvQ9CXS4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CenpvQ9CXS4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CenpvQ9CXS4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpvQ9CXS4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpvQ9CXS4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CenpvQ9CXS4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpvQ9CXS4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpvQ9CXS4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CenpvQ9CXS4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpvQ9CXS4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpvQ9CXS4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpvQ9CXS4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CenpvQ9CXS4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpvQ9CXS4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CenpvQ9CXS4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CenpvQ9CXS4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CenpvQ9CXS4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CenpvQ9CXS4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CenpvQ9CXS4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CenpvQ9CXS4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CenpvQ9CXS4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CenpvQ9CXS4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CenpvQ9CXS4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CenpvQ9CXS4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CenpvQ9CXS4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CenpvQ9CXS4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CenpvQ9CXS4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CenpvQ9CXS4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CenpvQ9CXS4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CenpvQ9CXS4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CenpvQ9CXS4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpvQ9CXS4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpvQ9CXS4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpvQ9CXS4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CenpvQ9CXS4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CenpvQ9CXS4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpvQ9CXS4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CenpvQ9CXS4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CenpvQ9CXS4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpvQ9CXS4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CenpvQ9CXS4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CenpvQ9CXS4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CenpvQ9CXS4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CenpvQ9CXS4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpvQ9CXS4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CenpvQ9CXS4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CenpvQ9CXS4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpvQ9CXS4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpvQ9CXS4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CenpvQ9CXS4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CenpvQ9CXS4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CenpvQ9CXS4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpvQ9CXS4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CenpvQ9CXS4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpvQ9CXS4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpvQ9CXS4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CenpvQ9CXS4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpvQ9CXS4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpvQ9CXS4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpvQ9CXS4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpvQ9CXS4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CenpvQ9CXS4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CenpvQ9CXS4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CenpvQ9CXS4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CenpvQ9CXS4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms