Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Cnot11Q9CWN7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Cnot11Q9CWN7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Cnot11Q9CWN7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Cnot11Q9CWN7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Cnot11Q9CWN7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Cnot11Q9CWN7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25,2■■□□□ 1,62
Cnot11Q9CWN7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Cnot11Q9CWN7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Cnot11Q9CWN7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Cnot11Q9CWN7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Cnot11Q9CWN7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Cnot11Q9CWN7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Cnot11Q9CWN7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Cnot11Q9CWN7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Cnot11Q9CWN7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25,14■■□□□ 1,61
Cnot11Q9CWN7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25,12■■□□□ 1,61
Cnot11Q9CWN7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Cnot11Q9CWN7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Cnot11Q9CWN7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Cnot11Q9CWN7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25,09■■□□□ 1,61
Cnot11Q9CWN7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Cnot11Q9CWN7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25,09■■□□□ 1,61
Cnot11Q9CWN7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Cnot11Q9CWN7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Cnot11Q9CWN7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Cnot11Q9CWN7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Cnot11Q9CWN7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,07■■□□□ 1,6
Cnot11Q9CWN7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Cnot11Q9CWN7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Cnot11Q9CWN7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Cnot11Q9CWN7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Cnot11Q9CWN7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Cnot11Q9CWN7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Cnot11Q9CWN7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Cnot11Q9CWN7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Cnot11Q9CWN7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Cnot11Q9CWN7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Cnot11Q9CWN7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Cnot11Q9CWN7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24,94■■□□□ 1,58
Cnot11Q9CWN7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Cnot11Q9CWN7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Cnot11Q9CWN7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Cnot11Q9CWN7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Cnot11Q9CWN7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Cnot11Q9CWN7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,84■■□□□ 1,57
Cnot11Q9CWN7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Cnot11Q9CWN7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Cnot11Q9CWN7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Cnot11Q9CWN7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Cnot11Q9CWN7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Cnot11Q9CWN7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Cnot11Q9CWN7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,56
Cnot11Q9CWN7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Cnot11Q9CWN7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Cnot11Q9CWN7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Cnot11Q9CWN7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Cnot11Q9CWN7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Cnot11Q9CWN7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Cnot11Q9CWN7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Cnot11Q9CWN7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24,78■■□□□ 1,56
Cnot11Q9CWN7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Cnot11Q9CWN7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Cnot11Q9CWN7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Cnot11Q9CWN7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Cnot11Q9CWN7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Cnot11Q9CWN7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Cnot11Q9CWN7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Cnot11Q9CWN7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,72■■□□□ 1,55
Cnot11Q9CWN7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Cnot11Q9CWN7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,7■■□□□ 1,54
Cnot11Q9CWN7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Cnot11Q9CWN7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Cnot11Q9CWN7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Cnot11Q9CWN7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Cnot11Q9CWN7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Cnot11Q9CWN7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Cnot11Q9CWN7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Cnot11Q9CWN7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24,65■■□□□ 1,54
Cnot11Q9CWN7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Cnot11Q9CWN7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
Cnot11Q9CWN7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Cnot11Q9CWN7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Cnot11Q9CWN7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Cnot11Q9CWN7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Cnot11Q9CWN7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Cnot11Q9CWN7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Cnot11Q9CWN7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Cnot11Q9CWN7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Cnot11Q9CWN7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Cnot11Q9CWN7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24,55■■□□□ 1,52
Cnot11Q9CWN7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Cnot11Q9CWN7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Cnot11Q9CWN7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24,55■■□□□ 1,52
Cnot11Q9CWN7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Cnot11Q9CWN7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Cnot11Q9CWN7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Cnot11Q9CWN7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Cnot11Q9CWN7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Cnot11Q9CWN7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
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