Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cnot11Q9CWN7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cnot11Q9CWN7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot11Q9CWN7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot11Q9CWN7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnot11Q9CWN7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cnot11Q9CWN7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnot11Q9CWN7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnot11Q9CWN7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnot11Q9CWN7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnot11Q9CWN7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnot11Q9CWN7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnot11Q9CWN7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnot11Q9CWN7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnot11Q9CWN7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cnot11Q9CWN7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Cnot11Q9CWN7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnot11Q9CWN7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cnot11Q9CWN7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnot11Q9CWN7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnot11Q9CWN7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnot11Q9CWN7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnot11Q9CWN7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnot11Q9CWN7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnot11Q9CWN7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnot11Q9CWN7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnot11Q9CWN7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnot11Q9CWN7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnot11Q9CWN7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnot11Q9CWN7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnot11Q9CWN7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnot11Q9CWN7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnot11Q9CWN7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnot11Q9CWN7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnot11Q9CWN7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnot11Q9CWN7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cnot11Q9CWN7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cnot11Q9CWN7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnot11Q9CWN7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnot11Q9CWN7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnot11Q9CWN7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnot11Q9CWN7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnot11Q9CWN7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnot11Q9CWN7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnot11Q9CWN7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnot11Q9CWN7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnot11Q9CWN7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnot11Q9CWN7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnot11Q9CWN7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnot11Q9CWN7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnot11Q9CWN7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnot11Q9CWN7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnot11Q9CWN7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cnot11Q9CWN7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnot11Q9CWN7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnot11Q9CWN7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnot11Q9CWN7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnot11Q9CWN7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnot11Q9CWN7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnot11Q9CWN7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnot11Q9CWN7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnot11Q9CWN7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnot11Q9CWN7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnot11Q9CWN7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnot11Q9CWN7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cnot11Q9CWN7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cnot11Q9CWN7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cnot11Q9CWN7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnot11Q9CWN7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cnot11Q9CWN7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cnot11Q9CWN7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cnot11Q9CWN7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cnot11Q9CWN7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cnot11Q9CWN7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cnot11Q9CWN7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnot11Q9CWN7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnot11Q9CWN7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cnot11Q9CWN7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnot11Q9CWN7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cnot11Q9CWN7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnot11Q9CWN7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnot11Q9CWN7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cnot11Q9CWN7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cnot11Q9CWN7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cnot11Q9CWN7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cnot11Q9CWN7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnot11Q9CWN7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cnot11Q9CWN7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnot11Q9CWN7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnot11Q9CWN7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cnot11Q9CWN7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnot11Q9CWN7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnot11Q9CWN7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnot11Q9CWN7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnot11Q9CWN7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cnot11Q9CWN7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnot11Q9CWN7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnot11Q9CWN7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cnot11Q9CWN7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cnot11Q9CWN7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms