Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smurf1Q9CUN6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smurf1Q9CUN6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smurf1Q9CUN6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smurf1Q9CUN6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smurf1Q9CUN6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smurf1Q9CUN6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smurf1Q9CUN6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smurf1Q9CUN6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smurf1Q9CUN6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smurf1Q9CUN6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smurf1Q9CUN6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smurf1Q9CUN6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smurf1Q9CUN6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smurf1Q9CUN6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smurf1Q9CUN6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smurf1Q9CUN6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smurf1Q9CUN6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smurf1Q9CUN6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smurf1Q9CUN6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smurf1Q9CUN6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smurf1Q9CUN6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smurf1Q9CUN6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smurf1Q9CUN6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Smurf1Q9CUN6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smurf1Q9CUN6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smurf1Q9CUN6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smurf1Q9CUN6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smurf1Q9CUN6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smurf1Q9CUN6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smurf1Q9CUN6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smurf1Q9CUN6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smurf1Q9CUN6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smurf1Q9CUN6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smurf1Q9CUN6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smurf1Q9CUN6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smurf1Q9CUN6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smurf1Q9CUN6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smurf1Q9CUN6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Smurf1Q9CUN6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smurf1Q9CUN6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smurf1Q9CUN6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smurf1Q9CUN6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smurf1Q9CUN6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smurf1Q9CUN6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smurf1Q9CUN6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smurf1Q9CUN6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smurf1Q9CUN6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smurf1Q9CUN6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smurf1Q9CUN6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smurf1Q9CUN6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smurf1Q9CUN6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smurf1Q9CUN6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smurf1Q9CUN6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smurf1Q9CUN6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smurf1Q9CUN6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smurf1Q9CUN6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smurf1Q9CUN6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smurf1Q9CUN6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Smurf1Q9CUN6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smurf1Q9CUN6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smurf1Q9CUN6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smurf1Q9CUN6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smurf1Q9CUN6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smurf1Q9CUN6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smurf1Q9CUN6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smurf1Q9CUN6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smurf1Q9CUN6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smurf1Q9CUN6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smurf1Q9CUN6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smurf1Q9CUN6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smurf1Q9CUN6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smurf1Q9CUN6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smurf1Q9CUN6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smurf1Q9CUN6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smurf1Q9CUN6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smurf1Q9CUN6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smurf1Q9CUN6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smurf1Q9CUN6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smurf1Q9CUN6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smurf1Q9CUN6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smurf1Q9CUN6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smurf1Q9CUN6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smurf1Q9CUN6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smurf1Q9CUN6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smurf1Q9CUN6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Smurf1Q9CUN6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smurf1Q9CUN6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smurf1Q9CUN6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smurf1Q9CUN6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Smurf1Q9CUN6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smurf1Q9CUN6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smurf1Q9CUN6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smurf1Q9CUN6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Smurf1Q9CUN6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smurf1Q9CUN6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smurf1Q9CUN6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smurf1Q9CUN6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smurf1Q9CUN6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smurf1Q9CUN6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms