Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930519P11RikQ9CUJ8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930519P11RikQ9CUJ8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930519P11RikQ9CUJ8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930519P11RikQ9CUJ8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930519P11RikQ9CUJ8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930519P11RikQ9CUJ8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930519P11RikQ9CUJ8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930519P11RikQ9CUJ8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930519P11RikQ9CUJ8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930519P11RikQ9CUJ8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930519P11RikQ9CUJ8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930519P11RikQ9CUJ8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930519P11RikQ9CUJ8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930519P11RikQ9CUJ8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930519P11RikQ9CUJ8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930519P11RikQ9CUJ8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930519P11RikQ9CUJ8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930519P11RikQ9CUJ8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930519P11RikQ9CUJ8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930519P11RikQ9CUJ8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930519P11RikQ9CUJ8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930519P11RikQ9CUJ8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930519P11RikQ9CUJ8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930519P11RikQ9CUJ8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930519P11RikQ9CUJ8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930519P11RikQ9CUJ8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930519P11RikQ9CUJ8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4930519P11RikQ9CUJ8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4930519P11RikQ9CUJ8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
4930519P11RikQ9CUJ8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4930519P11RikQ9CUJ8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4930519P11RikQ9CUJ8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930519P11RikQ9CUJ8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930519P11RikQ9CUJ8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930519P11RikQ9CUJ8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930519P11RikQ9CUJ8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930519P11RikQ9CUJ8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
4930519P11RikQ9CUJ8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930519P11RikQ9CUJ8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
4930519P11RikQ9CUJ8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
4930519P11RikQ9CUJ8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930519P11RikQ9CUJ8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930519P11RikQ9CUJ8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930519P11RikQ9CUJ8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930519P11RikQ9CUJ8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930519P11RikQ9CUJ8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930519P11RikQ9CUJ8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930519P11RikQ9CUJ8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930519P11RikQ9CUJ8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
4930519P11RikQ9CUJ8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930519P11RikQ9CUJ8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930519P11RikQ9CUJ8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930519P11RikQ9CUJ8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930519P11RikQ9CUJ8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930519P11RikQ9CUJ8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930519P11RikQ9CUJ8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930519P11RikQ9CUJ8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930519P11RikQ9CUJ8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
4930519P11RikQ9CUJ8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
4930519P11RikQ9CUJ8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930519P11RikQ9CUJ8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930519P11RikQ9CUJ8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
4930519P11RikQ9CUJ8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930519P11RikQ9CUJ8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930519P11RikQ9CUJ8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930519P11RikQ9CUJ8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930519P11RikQ9CUJ8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930519P11RikQ9CUJ8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930519P11RikQ9CUJ8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms