Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21,89■■□□□ 1,1
NmbQ9CR53 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
NmbQ9CR53 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21,87■■□□□ 1,09
NmbQ9CR53 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
NmbQ9CR53 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21,85■■□□□ 1,09
NmbQ9CR53 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21,85■■□□□ 1,09
NmbQ9CR53 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
NmbQ9CR53 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21,84■■□□□ 1,09
NmbQ9CR53 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
NmbQ9CR53 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,82■■□□□ 1,08
NmbQ9CR53 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21,82■■□□□ 1,08
NmbQ9CR53 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21,81■■□□□ 1,08
NmbQ9CR53 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,81■■□□□ 1,08
NmbQ9CR53 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
NmbQ9CR53 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
NmbQ9CR53 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
NmbQ9CR53 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,8■■□□□ 1,08
NmbQ9CR53 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
NmbQ9CR53 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,79■■□□□ 1,08
NmbQ9CR53 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
NmbQ9CR53 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
NmbQ9CR53 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,76■■□□□ 1,07
NmbQ9CR53 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
NmbQ9CR53 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21,75■■□□□ 1,07
NmbQ9CR53 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
NmbQ9CR53 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
NmbQ9CR53 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
NmbQ9CR53 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,71■■□□□ 1,07
NmbQ9CR53 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
NmbQ9CR53 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
NmbQ9CR53 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21,69■■□□□ 1,06
NmbQ9CR53 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
NmbQ9CR53 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
NmbQ9CR53 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
NmbQ9CR53 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
NmbQ9CR53 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21,68■■□□□ 1,06
NmbQ9CR53 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
NmbQ9CR53 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
NmbQ9CR53 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
NmbQ9CR53 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
NmbQ9CR53 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21,66■■□□□ 1,06
NmbQ9CR53 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21,65■■□□□ 1,06
NmbQ9CR53 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
NmbQ9CR53 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21,65■■□□□ 1,06
NmbQ9CR53 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
NmbQ9CR53 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
NmbQ9CR53 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
NmbQ9CR53 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
NmbQ9CR53 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
NmbQ9CR53 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
NmbQ9CR53 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21,62■■□□□ 1,05
NmbQ9CR53 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
NmbQ9CR53 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
NmbQ9CR53 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
NmbQ9CR53 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,6■■□□□ 1,05
NmbQ9CR53 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,56■■□□□ 1,04
NmbQ9CR53 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
NmbQ9CR53 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
NmbQ9CR53 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
NmbQ9CR53 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
NmbQ9CR53 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,53■■□□□ 1,04
NmbQ9CR53 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,51■■□□□ 1,03
NmbQ9CR53 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
NmbQ9CR53 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
NmbQ9CR53 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
NmbQ9CR53 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
NmbQ9CR53 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
NmbQ9CR53 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
NmbQ9CR53 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21,49■■□□□ 1,03
NmbQ9CR53 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
NmbQ9CR53 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
NmbQ9CR53 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
NmbQ9CR53 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
NmbQ9CR53 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21,44■■□□□ 1,02
NmbQ9CR53 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21,43■■□□□ 1,02
NmbQ9CR53 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,42■■□□□ 1,02
NmbQ9CR53 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
NmbQ9CR53 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
NmbQ9CR53 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21,41■■□□□ 1,02
NmbQ9CR53 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
NmbQ9CR53 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
NmbQ9CR53 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
NmbQ9CR53 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,02
NmbQ9CR53 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
NmbQ9CR53 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21,37■■□□□ 1,01
NmbQ9CR53 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
NmbQ9CR53 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
NmbQ9CR53 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,37■■□□□ 1,01
NmbQ9CR53 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21,36■■□□□ 1,01
NmbQ9CR53 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,36■■□□□ 1,01
NmbQ9CR53 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
NmbQ9CR53 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
NmbQ9CR53 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
NmbQ9CR53 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
NmbQ9CR53 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
NmbQ9CR53 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21,34■■□□□ 1,01
NmbQ9CR53 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,34■■□□□ 1,01
NmbQ9CR53 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
NmbQ9CR53 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
NmbQ9CR53 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56,2 ms