Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW2

Arl8b, ADP-ribosylation factor-like protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl8bQ9CQW2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Arl8bQ9CQW2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Arl8bQ9CQW2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Arl8bQ9CQW2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arl8bQ9CQW2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arl8bQ9CQW2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Arl8bQ9CQW2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Arl8bQ9CQW2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Arl8bQ9CQW2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arl8bQ9CQW2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Arl8bQ9CQW2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arl8bQ9CQW2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Arl8bQ9CQW2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arl8bQ9CQW2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Arl8bQ9CQW2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Arl8bQ9CQW2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Arl8bQ9CQW2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Arl8bQ9CQW2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Arl8bQ9CQW2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arl8bQ9CQW2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arl8bQ9CQW2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arl8bQ9CQW2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arl8bQ9CQW2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Arl8bQ9CQW2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arl8bQ9CQW2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arl8bQ9CQW2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Arl8bQ9CQW2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Arl8bQ9CQW2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Arl8bQ9CQW2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arl8bQ9CQW2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Arl8bQ9CQW2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Arl8bQ9CQW2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Arl8bQ9CQW2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arl8bQ9CQW2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Arl8bQ9CQW2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arl8bQ9CQW2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arl8bQ9CQW2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Arl8bQ9CQW2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Arl8bQ9CQW2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Arl8bQ9CQW2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Arl8bQ9CQW2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arl8bQ9CQW2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Arl8bQ9CQW2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Arl8bQ9CQW2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Arl8bQ9CQW2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arl8bQ9CQW2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arl8bQ9CQW2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arl8bQ9CQW2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arl8bQ9CQW2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arl8bQ9CQW2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arl8bQ9CQW2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arl8bQ9CQW2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arl8bQ9CQW2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arl8bQ9CQW2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arl8bQ9CQW2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arl8bQ9CQW2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Arl8bQ9CQW2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Arl8bQ9CQW2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Arl8bQ9CQW2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arl8bQ9CQW2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arl8bQ9CQW2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arl8bQ9CQW2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arl8bQ9CQW2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arl8bQ9CQW2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arl8bQ9CQW2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arl8bQ9CQW2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arl8bQ9CQW2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arl8bQ9CQW2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arl8bQ9CQW2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arl8bQ9CQW2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arl8bQ9CQW2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arl8bQ9CQW2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arl8bQ9CQW2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arl8bQ9CQW2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arl8bQ9CQW2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Arl8bQ9CQW2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arl8bQ9CQW2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Arl8bQ9CQW2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arl8bQ9CQW2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Arl8bQ9CQW2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arl8bQ9CQW2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arl8bQ9CQW2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arl8bQ9CQW2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arl8bQ9CQW2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arl8bQ9CQW2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arl8bQ9CQW2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arl8bQ9CQW2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arl8bQ9CQW2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arl8bQ9CQW2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arl8bQ9CQW2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arl8bQ9CQW2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arl8bQ9CQW2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arl8bQ9CQW2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arl8bQ9CQW2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arl8bQ9CQW2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arl8bQ9CQW2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arl8bQ9CQW2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arl8bQ9CQW2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arl8bQ9CQW2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arl8bQ9CQW2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms