Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD4

Chmp1b2, Charged multivesicular body protein 1b-2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b2Q9CQD4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chmp1b2Q9CQD4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chmp1b2Q9CQD4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chmp1b2Q9CQD4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chmp1b2Q9CQD4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chmp1b2Q9CQD4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp1b2Q9CQD4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp1b2Q9CQD4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chmp1b2Q9CQD4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Chmp1b2Q9CQD4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp1b2Q9CQD4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp1b2Q9CQD4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp1b2Q9CQD4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Chmp1b2Q9CQD4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp1b2Q9CQD4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp1b2Q9CQD4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp1b2Q9CQD4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp1b2Q9CQD4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp1b2Q9CQD4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp1b2Q9CQD4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp1b2Q9CQD4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp1b2Q9CQD4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp1b2Q9CQD4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp1b2Q9CQD4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Chmp1b2Q9CQD4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Chmp1b2Q9CQD4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chmp1b2Q9CQD4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp1b2Q9CQD4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp1b2Q9CQD4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp1b2Q9CQD4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp1b2Q9CQD4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp1b2Q9CQD4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp1b2Q9CQD4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp1b2Q9CQD4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp1b2Q9CQD4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp1b2Q9CQD4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp1b2Q9CQD4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp1b2Q9CQD4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp1b2Q9CQD4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chmp1b2Q9CQD4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp1b2Q9CQD4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp1b2Q9CQD4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp1b2Q9CQD4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp1b2Q9CQD4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp1b2Q9CQD4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp1b2Q9CQD4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp1b2Q9CQD4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp1b2Q9CQD4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp1b2Q9CQD4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp1b2Q9CQD4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chmp1b2Q9CQD4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp1b2Q9CQD4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp1b2Q9CQD4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp1b2Q9CQD4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp1b2Q9CQD4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp1b2Q9CQD4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp1b2Q9CQD4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp1b2Q9CQD4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp1b2Q9CQD4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp1b2Q9CQD4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp1b2Q9CQD4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp1b2Q9CQD4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp1b2Q9CQD4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp1b2Q9CQD4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Chmp1b2Q9CQD4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Chmp1b2Q9CQD4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp1b2Q9CQD4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp1b2Q9CQD4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Chmp1b2Q9CQD4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chmp1b2Q9CQD4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp1b2Q9CQD4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chmp1b2Q9CQD4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chmp1b2Q9CQD4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp1b2Q9CQD4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp1b2Q9CQD4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Chmp1b2Q9CQD4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp1b2Q9CQD4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp1b2Q9CQD4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chmp1b2Q9CQD4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp1b2Q9CQD4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp1b2Q9CQD4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp1b2Q9CQD4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp1b2Q9CQD4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp1b2Q9CQD4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp1b2Q9CQD4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Chmp1b2Q9CQD4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp1b2Q9CQD4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp1b2Q9CQD4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp1b2Q9CQD4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp1b2Q9CQD4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp1b2Q9CQD4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp1b2Q9CQD4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp1b2Q9CQD4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp1b2Q9CQD4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp1b2Q9CQD4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp1b2Q9CQD4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp1b2Q9CQD4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp1b2Q9CQD4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Chmp1b2Q9CQD4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Chmp1b2Q9CQD4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms