Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pole4Q9CQ36 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pole4Q9CQ36 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pole4Q9CQ36 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pole4Q9CQ36 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pole4Q9CQ36 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pole4Q9CQ36 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pole4Q9CQ36 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pole4Q9CQ36 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pole4Q9CQ36 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pole4Q9CQ36 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pole4Q9CQ36 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pole4Q9CQ36 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pole4Q9CQ36 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pole4Q9CQ36 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pole4Q9CQ36 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pole4Q9CQ36 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pole4Q9CQ36 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pole4Q9CQ36 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pole4Q9CQ36 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pole4Q9CQ36 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pole4Q9CQ36 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pole4Q9CQ36 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pole4Q9CQ36 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pole4Q9CQ36 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pole4Q9CQ36 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pole4Q9CQ36 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pole4Q9CQ36 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pole4Q9CQ36 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pole4Q9CQ36 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pole4Q9CQ36 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pole4Q9CQ36 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pole4Q9CQ36 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pole4Q9CQ36 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pole4Q9CQ36 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pole4Q9CQ36 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pole4Q9CQ36 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pole4Q9CQ36 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pole4Q9CQ36 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pole4Q9CQ36 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pole4Q9CQ36 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pole4Q9CQ36 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pole4Q9CQ36 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pole4Q9CQ36 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pole4Q9CQ36 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pole4Q9CQ36 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pole4Q9CQ36 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pole4Q9CQ36 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pole4Q9CQ36 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pole4Q9CQ36 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pole4Q9CQ36 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pole4Q9CQ36 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pole4Q9CQ36 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pole4Q9CQ36 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pole4Q9CQ36 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pole4Q9CQ36 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pole4Q9CQ36 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pole4Q9CQ36 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pole4Q9CQ36 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pole4Q9CQ36 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pole4Q9CQ36 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pole4Q9CQ36 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pole4Q9CQ36 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pole4Q9CQ36 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pole4Q9CQ36 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pole4Q9CQ36 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pole4Q9CQ36 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pole4Q9CQ36 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pole4Q9CQ36 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pole4Q9CQ36 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pole4Q9CQ36 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pole4Q9CQ36 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pole4Q9CQ36 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pole4Q9CQ36 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pole4Q9CQ36 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pole4Q9CQ36 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pole4Q9CQ36 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pole4Q9CQ36 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pole4Q9CQ36 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pole4Q9CQ36 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pole4Q9CQ36 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pole4Q9CQ36 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pole4Q9CQ36 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pole4Q9CQ36 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pole4Q9CQ36 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pole4Q9CQ36 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pole4Q9CQ36 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pole4Q9CQ36 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pole4Q9CQ36 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pole4Q9CQ36 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pole4Q9CQ36 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pole4Q9CQ36 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pole4Q9CQ36 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pole4Q9CQ36 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pole4Q9CQ36 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pole4Q9CQ36 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pole4Q9CQ36 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pole4Q9CQ36 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pole4Q9CQ36 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pole4Q9CQ36 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms