Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lrrc4Q99PH1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrrc4Q99PH1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrrc4Q99PH1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lrrc4Q99PH1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc4Q99PH1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc4Q99PH1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc4Q99PH1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Lrrc4Q99PH1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lrrc4Q99PH1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc4Q99PH1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc4Q99PH1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lrrc4Q99PH1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lrrc4Q99PH1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lrrc4Q99PH1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lrrc4Q99PH1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lrrc4Q99PH1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrc4Q99PH1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lrrc4Q99PH1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc4Q99PH1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc4Q99PH1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc4Q99PH1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc4Q99PH1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc4Q99PH1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc4Q99PH1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc4Q99PH1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc4Q99PH1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc4Q99PH1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc4Q99PH1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc4Q99PH1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc4Q99PH1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc4Q99PH1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc4Q99PH1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc4Q99PH1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc4Q99PH1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc4Q99PH1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc4Q99PH1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrc4Q99PH1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc4Q99PH1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc4Q99PH1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc4Q99PH1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc4Q99PH1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrc4Q99PH1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc4Q99PH1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc4Q99PH1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc4Q99PH1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc4Q99PH1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc4Q99PH1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc4Q99PH1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc4Q99PH1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc4Q99PH1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc4Q99PH1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc4Q99PH1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc4Q99PH1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc4Q99PH1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc4Q99PH1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc4Q99PH1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc4Q99PH1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc4Q99PH1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrc4Q99PH1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc4Q99PH1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc4Q99PH1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc4Q99PH1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc4Q99PH1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc4Q99PH1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc4Q99PH1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc4Q99PH1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrc4Q99PH1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc4Q99PH1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Lrrc4Q99PH1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc4Q99PH1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lrrc4Q99PH1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc4Q99PH1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lrrc4Q99PH1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc4Q99PH1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Lrrc4Q99PH1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Lrrc4Q99PH1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lrrc4Q99PH1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc4Q99PH1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc4Q99PH1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Lrrc4Q99PH1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc4Q99PH1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc4Q99PH1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lrrc4Q99PH1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lrrc4Q99PH1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc4Q99PH1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Lrrc4Q99PH1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc4Q99PH1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Lrrc4Q99PH1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc4Q99PH1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc4Q99PH1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc4Q99PH1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc4Q99PH1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lrrc4Q99PH1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrrc4Q99PH1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lrrc4Q99PH1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrc4Q99PH1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lrrc4Q99PH1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrc4Q99PH1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lrrc4Q99PH1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms