Protein–RNA interactions for Protein: Q99M03

Rwdd2b, RWD domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd2bQ99M03 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rwdd2bQ99M03 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rwdd2bQ99M03 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rwdd2bQ99M03 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rwdd2bQ99M03 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rwdd2bQ99M03 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rwdd2bQ99M03 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rwdd2bQ99M03 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rwdd2bQ99M03 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rwdd2bQ99M03 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rwdd2bQ99M03 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rwdd2bQ99M03 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rwdd2bQ99M03 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rwdd2bQ99M03 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rwdd2bQ99M03 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rwdd2bQ99M03 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rwdd2bQ99M03 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rwdd2bQ99M03 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rwdd2bQ99M03 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rwdd2bQ99M03 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rwdd2bQ99M03 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rwdd2bQ99M03 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rwdd2bQ99M03 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rwdd2bQ99M03 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rwdd2bQ99M03 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rwdd2bQ99M03 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rwdd2bQ99M03 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rwdd2bQ99M03 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rwdd2bQ99M03 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rwdd2bQ99M03 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rwdd2bQ99M03 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rwdd2bQ99M03 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rwdd2bQ99M03 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rwdd2bQ99M03 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rwdd2bQ99M03 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rwdd2bQ99M03 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd2bQ99M03 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd2bQ99M03 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rwdd2bQ99M03 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rwdd2bQ99M03 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rwdd2bQ99M03 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rwdd2bQ99M03 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rwdd2bQ99M03 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rwdd2bQ99M03 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rwdd2bQ99M03 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rwdd2bQ99M03 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rwdd2bQ99M03 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rwdd2bQ99M03 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rwdd2bQ99M03 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd2bQ99M03 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd2bQ99M03 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rwdd2bQ99M03 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rwdd2bQ99M03 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rwdd2bQ99M03 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rwdd2bQ99M03 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rwdd2bQ99M03 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rwdd2bQ99M03 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rwdd2bQ99M03 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rwdd2bQ99M03 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rwdd2bQ99M03 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rwdd2bQ99M03 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rwdd2bQ99M03 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rwdd2bQ99M03 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rwdd2bQ99M03 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rwdd2bQ99M03 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rwdd2bQ99M03 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rwdd2bQ99M03 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rwdd2bQ99M03 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rwdd2bQ99M03 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rwdd2bQ99M03 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rwdd2bQ99M03 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rwdd2bQ99M03 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rwdd2bQ99M03 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rwdd2bQ99M03 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rwdd2bQ99M03 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rwdd2bQ99M03 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rwdd2bQ99M03 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rwdd2bQ99M03 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rwdd2bQ99M03 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rwdd2bQ99M03 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rwdd2bQ99M03 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rwdd2bQ99M03 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rwdd2bQ99M03 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rwdd2bQ99M03 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rwdd2bQ99M03 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rwdd2bQ99M03 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rwdd2bQ99M03 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rwdd2bQ99M03 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rwdd2bQ99M03 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rwdd2bQ99M03 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rwdd2bQ99M03 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rwdd2bQ99M03 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rwdd2bQ99M03 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rwdd2bQ99M03 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rwdd2bQ99M03 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rwdd2bQ99M03 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rwdd2bQ99M03 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rwdd2bQ99M03 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rwdd2bQ99M03 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rwdd2bQ99M03 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms