Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nmd3Q99L48 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nmd3Q99L48 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nmd3Q99L48 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nmd3Q99L48 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nmd3Q99L48 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nmd3Q99L48 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nmd3Q99L48 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nmd3Q99L48 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nmd3Q99L48 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nmd3Q99L48 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nmd3Q99L48 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nmd3Q99L48 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nmd3Q99L48 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nmd3Q99L48 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nmd3Q99L48 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nmd3Q99L48 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nmd3Q99L48 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nmd3Q99L48 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nmd3Q99L48 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nmd3Q99L48 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nmd3Q99L48 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nmd3Q99L48 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nmd3Q99L48 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nmd3Q99L48 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nmd3Q99L48 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nmd3Q99L48 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nmd3Q99L48 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nmd3Q99L48 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nmd3Q99L48 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nmd3Q99L48 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nmd3Q99L48 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nmd3Q99L48 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nmd3Q99L48 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nmd3Q99L48 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nmd3Q99L48 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nmd3Q99L48 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nmd3Q99L48 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nmd3Q99L48 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nmd3Q99L48 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nmd3Q99L48 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nmd3Q99L48 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nmd3Q99L48 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nmd3Q99L48 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nmd3Q99L48 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nmd3Q99L48 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nmd3Q99L48 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nmd3Q99L48 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nmd3Q99L48 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nmd3Q99L48 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nmd3Q99L48 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nmd3Q99L48 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nmd3Q99L48 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nmd3Q99L48 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nmd3Q99L48 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nmd3Q99L48 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nmd3Q99L48 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nmd3Q99L48 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nmd3Q99L48 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nmd3Q99L48 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nmd3Q99L48 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nmd3Q99L48 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nmd3Q99L48 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nmd3Q99L48 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nmd3Q99L48 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nmd3Q99L48 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nmd3Q99L48 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nmd3Q99L48 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Nmd3Q99L48 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nmd3Q99L48 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nmd3Q99L48 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nmd3Q99L48 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nmd3Q99L48 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nmd3Q99L48 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nmd3Q99L48 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nmd3Q99L48 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nmd3Q99L48 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nmd3Q99L48 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nmd3Q99L48 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nmd3Q99L48 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nmd3Q99L48 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nmd3Q99L48 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nmd3Q99L48 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nmd3Q99L48 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nmd3Q99L48 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nmd3Q99L48 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Nmd3Q99L48 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Nmd3Q99L48 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nmd3Q99L48 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nmd3Q99L48 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nmd3Q99L48 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nmd3Q99L48 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nmd3Q99L48 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nmd3Q99L48 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nmd3Q99L48 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nmd3Q99L48 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nmd3Q99L48 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nmd3Q99L48 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nmd3Q99L48 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nmd3Q99L48 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms