Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lactb2Q99KR3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lactb2Q99KR3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lactb2Q99KR3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lactb2Q99KR3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lactb2Q99KR3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lactb2Q99KR3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lactb2Q99KR3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lactb2Q99KR3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lactb2Q99KR3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lactb2Q99KR3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lactb2Q99KR3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Lactb2Q99KR3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lactb2Q99KR3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lactb2Q99KR3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lactb2Q99KR3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Lactb2Q99KR3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lactb2Q99KR3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lactb2Q99KR3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lactb2Q99KR3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lactb2Q99KR3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lactb2Q99KR3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lactb2Q99KR3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lactb2Q99KR3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lactb2Q99KR3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lactb2Q99KR3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lactb2Q99KR3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Lactb2Q99KR3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lactb2Q99KR3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lactb2Q99KR3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Lactb2Q99KR3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Lactb2Q99KR3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Lactb2Q99KR3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lactb2Q99KR3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Lactb2Q99KR3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Lactb2Q99KR3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Lactb2Q99KR3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lactb2Q99KR3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Lactb2Q99KR3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Lactb2Q99KR3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Lactb2Q99KR3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Lactb2Q99KR3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lactb2Q99KR3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lactb2Q99KR3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lactb2Q99KR3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lactb2Q99KR3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Lactb2Q99KR3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Lactb2Q99KR3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Lactb2Q99KR3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lactb2Q99KR3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lactb2Q99KR3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Lactb2Q99KR3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Lactb2Q99KR3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lactb2Q99KR3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Lactb2Q99KR3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Lactb2Q99KR3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Lactb2Q99KR3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lactb2Q99KR3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lactb2Q99KR3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lactb2Q99KR3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lactb2Q99KR3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lactb2Q99KR3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lactb2Q99KR3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lactb2Q99KR3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lactb2Q99KR3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lactb2Q99KR3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lactb2Q99KR3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lactb2Q99KR3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Lactb2Q99KR3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lactb2Q99KR3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lactb2Q99KR3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lactb2Q99KR3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lactb2Q99KR3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lactb2Q99KR3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lactb2Q99KR3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lactb2Q99KR3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lactb2Q99KR3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Lactb2Q99KR3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lactb2Q99KR3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Lactb2Q99KR3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lactb2Q99KR3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lactb2Q99KR3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lactb2Q99KR3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lactb2Q99KR3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lactb2Q99KR3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lactb2Q99KR3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lactb2Q99KR3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lactb2Q99KR3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lactb2Q99KR3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lactb2Q99KR3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lactb2Q99KR3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lactb2Q99KR3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lactb2Q99KR3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lactb2Q99KR3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lactb2Q99KR3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lactb2Q99KR3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lactb2Q99KR3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lactb2Q99KR3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lactb2Q99KR3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lactb2Q99KR3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms