Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpf19Q99KP6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpf19Q99KP6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpf19Q99KP6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prpf19Q99KP6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prpf19Q99KP6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prpf19Q99KP6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prpf19Q99KP6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Prpf19Q99KP6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Prpf19Q99KP6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf19Q99KP6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf19Q99KP6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf19Q99KP6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Prpf19Q99KP6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf19Q99KP6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prpf19Q99KP6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prpf19Q99KP6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prpf19Q99KP6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prpf19Q99KP6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prpf19Q99KP6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpf19Q99KP6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prpf19Q99KP6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prpf19Q99KP6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prpf19Q99KP6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpf19Q99KP6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prpf19Q99KP6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf19Q99KP6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf19Q99KP6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prpf19Q99KP6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prpf19Q99KP6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf19Q99KP6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prpf19Q99KP6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prpf19Q99KP6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf19Q99KP6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prpf19Q99KP6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpf19Q99KP6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prpf19Q99KP6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prpf19Q99KP6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prpf19Q99KP6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prpf19Q99KP6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf19Q99KP6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prpf19Q99KP6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prpf19Q99KP6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prpf19Q99KP6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prpf19Q99KP6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf19Q99KP6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prpf19Q99KP6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prpf19Q99KP6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prpf19Q99KP6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf19Q99KP6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf19Q99KP6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prpf19Q99KP6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prpf19Q99KP6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prpf19Q99KP6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf19Q99KP6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf19Q99KP6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpf19Q99KP6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpf19Q99KP6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpf19Q99KP6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpf19Q99KP6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf19Q99KP6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf19Q99KP6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf19Q99KP6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prpf19Q99KP6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf19Q99KP6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prpf19Q99KP6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpf19Q99KP6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpf19Q99KP6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prpf19Q99KP6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prpf19Q99KP6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf19Q99KP6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf19Q99KP6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf19Q99KP6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf19Q99KP6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf19Q99KP6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf19Q99KP6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf19Q99KP6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf19Q99KP6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf19Q99KP6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf19Q99KP6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf19Q99KP6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf19Q99KP6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf19Q99KP6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf19Q99KP6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf19Q99KP6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf19Q99KP6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf19Q99KP6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf19Q99KP6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf19Q99KP6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf19Q99KP6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf19Q99KP6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf19Q99KP6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf19Q99KP6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpf19Q99KP6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf19Q99KP6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf19Q99KP6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf19Q99KP6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf19Q99KP6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf19Q99KP6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf19Q99KP6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms