Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cdk9Q99J95 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdk9Q99J95 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdk9Q99J95 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cdk9Q99J95 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdk9Q99J95 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk9Q99J95 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cdk9Q99J95 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk9Q99J95 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk9Q99J95 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdk9Q99J95 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cdk9Q99J95 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cdk9Q99J95 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk9Q99J95 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk9Q99J95 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdk9Q99J95 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdk9Q99J95 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdk9Q99J95 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk9Q99J95 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk9Q99J95 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdk9Q99J95 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdk9Q99J95 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cdk9Q99J95 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk9Q99J95 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk9Q99J95 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdk9Q99J95 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk9Q99J95 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdk9Q99J95 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cdk9Q99J95 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk9Q99J95 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk9Q99J95 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdk9Q99J95 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdk9Q99J95 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk9Q99J95 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk9Q99J95 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cdk9Q99J95 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk9Q99J95 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk9Q99J95 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdk9Q99J95 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cdk9Q99J95 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk9Q99J95 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk9Q99J95 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdk9Q99J95 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk9Q99J95 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdk9Q99J95 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk9Q99J95 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdk9Q99J95 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdk9Q99J95 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk9Q99J95 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdk9Q99J95 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdk9Q99J95 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cdk9Q99J95 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cdk9Q99J95 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk9Q99J95 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk9Q99J95 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdk9Q99J95 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdk9Q99J95 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdk9Q99J95 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdk9Q99J95 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdk9Q99J95 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk9Q99J95 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdk9Q99J95 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdk9Q99J95 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk9Q99J95 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk9Q99J95 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdk9Q99J95 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdk9Q99J95 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk9Q99J95 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdk9Q99J95 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk9Q99J95 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdk9Q99J95 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk9Q99J95 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdk9Q99J95 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk9Q99J95 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk9Q99J95 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdk9Q99J95 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdk9Q99J95 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdk9Q99J95 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdk9Q99J95 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk9Q99J95 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk9Q99J95 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdk9Q99J95 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdk9Q99J95 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk9Q99J95 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk9Q99J95 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk9Q99J95 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk9Q99J95 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk9Q99J95 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdk9Q99J95 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk9Q99J95 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdk9Q99J95 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cdk9Q99J95 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk9Q99J95 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk9Q99J95 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdk9Q99J95 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk9Q99J95 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk9Q99J95 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk9Q99J95 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk9Q99J95 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk9Q99J95 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms