Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ophn1Q99J31 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ophn1Q99J31 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ophn1Q99J31 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ophn1Q99J31 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ophn1Q99J31 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ophn1Q99J31 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ophn1Q99J31 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ophn1Q99J31 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ophn1Q99J31 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ophn1Q99J31 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ophn1Q99J31 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ophn1Q99J31 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ophn1Q99J31 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ophn1Q99J31 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ophn1Q99J31 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ophn1Q99J31 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ophn1Q99J31 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ophn1Q99J31 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ophn1Q99J31 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ophn1Q99J31 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ophn1Q99J31 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ophn1Q99J31 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ophn1Q99J31 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ophn1Q99J31 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ophn1Q99J31 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ophn1Q99J31 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ophn1Q99J31 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ophn1Q99J31 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ophn1Q99J31 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ophn1Q99J31 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ophn1Q99J31 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ophn1Q99J31 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ophn1Q99J31 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ophn1Q99J31 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ophn1Q99J31 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ophn1Q99J31 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ophn1Q99J31 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ophn1Q99J31 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ophn1Q99J31 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ophn1Q99J31 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ophn1Q99J31 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ophn1Q99J31 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ophn1Q99J31 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ophn1Q99J31 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ophn1Q99J31 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ophn1Q99J31 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ophn1Q99J31 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ophn1Q99J31 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ophn1Q99J31 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ophn1Q99J31 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ophn1Q99J31 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ophn1Q99J31 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ophn1Q99J31 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ophn1Q99J31 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ophn1Q99J31 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ophn1Q99J31 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ophn1Q99J31 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ophn1Q99J31 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ophn1Q99J31 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ophn1Q99J31 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ophn1Q99J31 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ophn1Q99J31 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ophn1Q99J31 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ophn1Q99J31 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ophn1Q99J31 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ophn1Q99J31 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ophn1Q99J31 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ophn1Q99J31 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ophn1Q99J31 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ophn1Q99J31 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ophn1Q99J31 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ophn1Q99J31 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ophn1Q99J31 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ophn1Q99J31 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ophn1Q99J31 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ophn1Q99J31 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ophn1Q99J31 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ophn1Q99J31 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ophn1Q99J31 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ophn1Q99J31 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ophn1Q99J31 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ophn1Q99J31 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ophn1Q99J31 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ophn1Q99J31 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ophn1Q99J31 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ophn1Q99J31 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ophn1Q99J31 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ophn1Q99J31 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ophn1Q99J31 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ophn1Q99J31 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ophn1Q99J31 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ophn1Q99J31 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ophn1Q99J31 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ophn1Q99J31 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ophn1Q99J31 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ophn1Q99J31 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ophn1Q99J31 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ophn1Q99J31 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ophn1Q99J31 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms