Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sntg1Q925E1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sntg1Q925E1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sntg1Q925E1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sntg1Q925E1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sntg1Q925E1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sntg1Q925E1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sntg1Q925E1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sntg1Q925E1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sntg1Q925E1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sntg1Q925E1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sntg1Q925E1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sntg1Q925E1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sntg1Q925E1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sntg1Q925E1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sntg1Q925E1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sntg1Q925E1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sntg1Q925E1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sntg1Q925E1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sntg1Q925E1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sntg1Q925E1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sntg1Q925E1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sntg1Q925E1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sntg1Q925E1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sntg1Q925E1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sntg1Q925E1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sntg1Q925E1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sntg1Q925E1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sntg1Q925E1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sntg1Q925E1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sntg1Q925E1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sntg1Q925E1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sntg1Q925E1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sntg1Q925E1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sntg1Q925E1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sntg1Q925E1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sntg1Q925E1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sntg1Q925E1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sntg1Q925E1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sntg1Q925E1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sntg1Q925E1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sntg1Q925E1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sntg1Q925E1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sntg1Q925E1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sntg1Q925E1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sntg1Q925E1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sntg1Q925E1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sntg1Q925E1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sntg1Q925E1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sntg1Q925E1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sntg1Q925E1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sntg1Q925E1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sntg1Q925E1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sntg1Q925E1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sntg1Q925E1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sntg1Q925E1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sntg1Q925E1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sntg1Q925E1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sntg1Q925E1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sntg1Q925E1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sntg1Q925E1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sntg1Q925E1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sntg1Q925E1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sntg1Q925E1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sntg1Q925E1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sntg1Q925E1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sntg1Q925E1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sntg1Q925E1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sntg1Q925E1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sntg1Q925E1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sntg1Q925E1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sntg1Q925E1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sntg1Q925E1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sntg1Q925E1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sntg1Q925E1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sntg1Q925E1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sntg1Q925E1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sntg1Q925E1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sntg1Q925E1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sntg1Q925E1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sntg1Q925E1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sntg1Q925E1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sntg1Q925E1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sntg1Q925E1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sntg1Q925E1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sntg1Q925E1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sntg1Q925E1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sntg1Q925E1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sntg1Q925E1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sntg1Q925E1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sntg1Q925E1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sntg1Q925E1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sntg1Q925E1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sntg1Q925E1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sntg1Q925E1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sntg1Q925E1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sntg1Q925E1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sntg1Q925E1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sntg1Q925E1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sntg1Q925E1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms