Protein–RNA interactions for Protein: Q91YQ1

Rab29, Ras-related protein Rab-7L1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab29Q91YQ1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab29Q91YQ1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab29Q91YQ1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab29Q91YQ1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab29Q91YQ1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab29Q91YQ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab29Q91YQ1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab29Q91YQ1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab29Q91YQ1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab29Q91YQ1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab29Q91YQ1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rab29Q91YQ1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab29Q91YQ1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab29Q91YQ1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab29Q91YQ1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab29Q91YQ1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab29Q91YQ1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab29Q91YQ1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab29Q91YQ1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab29Q91YQ1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab29Q91YQ1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab29Q91YQ1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab29Q91YQ1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab29Q91YQ1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab29Q91YQ1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab29Q91YQ1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab29Q91YQ1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab29Q91YQ1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab29Q91YQ1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab29Q91YQ1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab29Q91YQ1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab29Q91YQ1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab29Q91YQ1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab29Q91YQ1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rab29Q91YQ1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab29Q91YQ1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab29Q91YQ1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab29Q91YQ1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab29Q91YQ1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab29Q91YQ1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab29Q91YQ1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rab29Q91YQ1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab29Q91YQ1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rab29Q91YQ1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rab29Q91YQ1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rab29Q91YQ1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rab29Q91YQ1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Rab29Q91YQ1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab29Q91YQ1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rab29Q91YQ1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab29Q91YQ1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab29Q91YQ1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rab29Q91YQ1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rab29Q91YQ1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rab29Q91YQ1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rab29Q91YQ1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rab29Q91YQ1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rab29Q91YQ1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rab29Q91YQ1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab29Q91YQ1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab29Q91YQ1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rab29Q91YQ1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab29Q91YQ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rab29Q91YQ1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab29Q91YQ1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rab29Q91YQ1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab29Q91YQ1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rab29Q91YQ1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rab29Q91YQ1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab29Q91YQ1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rab29Q91YQ1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Rab29Q91YQ1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab29Q91YQ1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab29Q91YQ1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rab29Q91YQ1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rab29Q91YQ1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab29Q91YQ1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab29Q91YQ1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab29Q91YQ1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab29Q91YQ1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab29Q91YQ1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab29Q91YQ1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rab29Q91YQ1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab29Q91YQ1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab29Q91YQ1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab29Q91YQ1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab29Q91YQ1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab29Q91YQ1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab29Q91YQ1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab29Q91YQ1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab29Q91YQ1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab29Q91YQ1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab29Q91YQ1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab29Q91YQ1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab29Q91YQ1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rab29Q91YQ1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab29Q91YQ1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab29Q91YQ1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab29Q91YQ1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab29Q91YQ1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms