Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS3

Cbx7, Chromobox protein homolog 7, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx7Q8VDS3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cbx7Q8VDS3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cbx7Q8VDS3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cbx7Q8VDS3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cbx7Q8VDS3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cbx7Q8VDS3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cbx7Q8VDS3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cbx7Q8VDS3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cbx7Q8VDS3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cbx7Q8VDS3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cbx7Q8VDS3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cbx7Q8VDS3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cbx7Q8VDS3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cbx7Q8VDS3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cbx7Q8VDS3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cbx7Q8VDS3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cbx7Q8VDS3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cbx7Q8VDS3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cbx7Q8VDS3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cbx7Q8VDS3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cbx7Q8VDS3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cbx7Q8VDS3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cbx7Q8VDS3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cbx7Q8VDS3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cbx7Q8VDS3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cbx7Q8VDS3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cbx7Q8VDS3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cbx7Q8VDS3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx7Q8VDS3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx7Q8VDS3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cbx7Q8VDS3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cbx7Q8VDS3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cbx7Q8VDS3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cbx7Q8VDS3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cbx7Q8VDS3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cbx7Q8VDS3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx7Q8VDS3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx7Q8VDS3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cbx7Q8VDS3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cbx7Q8VDS3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cbx7Q8VDS3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cbx7Q8VDS3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx7Q8VDS3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx7Q8VDS3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cbx7Q8VDS3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cbx7Q8VDS3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cbx7Q8VDS3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cbx7Q8VDS3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cbx7Q8VDS3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cbx7Q8VDS3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cbx7Q8VDS3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cbx7Q8VDS3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cbx7Q8VDS3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx7Q8VDS3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx7Q8VDS3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cbx7Q8VDS3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cbx7Q8VDS3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cbx7Q8VDS3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx7Q8VDS3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx7Q8VDS3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cbx7Q8VDS3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cbx7Q8VDS3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cbx7Q8VDS3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cbx7Q8VDS3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cbx7Q8VDS3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cbx7Q8VDS3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx7Q8VDS3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx7Q8VDS3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx7Q8VDS3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cbx7Q8VDS3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cbx7Q8VDS3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cbx7Q8VDS3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx7Q8VDS3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx7Q8VDS3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cbx7Q8VDS3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cbx7Q8VDS3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cbx7Q8VDS3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cbx7Q8VDS3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cbx7Q8VDS3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cbx7Q8VDS3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cbx7Q8VDS3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cbx7Q8VDS3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cbx7Q8VDS3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cbx7Q8VDS3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cbx7Q8VDS3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cbx7Q8VDS3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cbx7Q8VDS3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cbx7Q8VDS3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cbx7Q8VDS3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cbx7Q8VDS3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx7Q8VDS3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cbx7Q8VDS3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cbx7Q8VDS3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cbx7Q8VDS3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cbx7Q8VDS3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cbx7Q8VDS3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cbx7Q8VDS3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx7Q8VDS3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cbx7Q8VDS3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cbx7Q8VDS3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms