Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm8Q8R4D5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm8Q8R4D5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trpm8Q8R4D5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpm8Q8R4D5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpm8Q8R4D5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trpm8Q8R4D5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trpm8Q8R4D5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Trpm8Q8R4D5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trpm8Q8R4D5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trpm8Q8R4D5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trpm8Q8R4D5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trpm8Q8R4D5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trpm8Q8R4D5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trpm8Q8R4D5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trpm8Q8R4D5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trpm8Q8R4D5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trpm8Q8R4D5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trpm8Q8R4D5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trpm8Q8R4D5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpm8Q8R4D5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trpm8Q8R4D5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpm8Q8R4D5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpm8Q8R4D5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trpm8Q8R4D5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trpm8Q8R4D5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trpm8Q8R4D5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trpm8Q8R4D5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trpm8Q8R4D5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trpm8Q8R4D5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpm8Q8R4D5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trpm8Q8R4D5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trpm8Q8R4D5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trpm8Q8R4D5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trpm8Q8R4D5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpm8Q8R4D5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpm8Q8R4D5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trpm8Q8R4D5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trpm8Q8R4D5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpm8Q8R4D5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpm8Q8R4D5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm8Q8R4D5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm8Q8R4D5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trpm8Q8R4D5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpm8Q8R4D5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpm8Q8R4D5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Trpm8Q8R4D5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trpm8Q8R4D5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trpm8Q8R4D5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trpm8Q8R4D5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trpm8Q8R4D5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpm8Q8R4D5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpm8Q8R4D5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpm8Q8R4D5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpm8Q8R4D5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpm8Q8R4D5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpm8Q8R4D5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpm8Q8R4D5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm8Q8R4D5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpm8Q8R4D5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpm8Q8R4D5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpm8Q8R4D5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm8Q8R4D5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm8Q8R4D5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpm8Q8R4D5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm8Q8R4D5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpm8Q8R4D5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpm8Q8R4D5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpm8Q8R4D5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm8Q8R4D5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm8Q8R4D5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm8Q8R4D5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpm8Q8R4D5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpm8Q8R4D5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpm8Q8R4D5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpm8Q8R4D5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpm8Q8R4D5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpm8Q8R4D5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm8Q8R4D5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpm8Q8R4D5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm8Q8R4D5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm8Q8R4D5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpm8Q8R4D5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpm8Q8R4D5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpm8Q8R4D5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm8Q8R4D5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trpm8Q8R4D5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm8Q8R4D5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpm8Q8R4D5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpm8Q8R4D5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpm8Q8R4D5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm8Q8R4D5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpm8Q8R4D5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpm8Q8R4D5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpm8Q8R4D5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trpm8Q8R4D5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm8Q8R4D5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm8Q8R4D5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm8Q8R4D5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm8Q8R4D5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
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