Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc58Q8R3Q6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc58Q8R3Q6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc58Q8R3Q6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc58Q8R3Q6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc58Q8R3Q6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc58Q8R3Q6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc58Q8R3Q6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc58Q8R3Q6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc58Q8R3Q6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc58Q8R3Q6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc58Q8R3Q6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc58Q8R3Q6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc58Q8R3Q6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc58Q8R3Q6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc58Q8R3Q6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc58Q8R3Q6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc58Q8R3Q6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc58Q8R3Q6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc58Q8R3Q6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc58Q8R3Q6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc58Q8R3Q6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc58Q8R3Q6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc58Q8R3Q6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc58Q8R3Q6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc58Q8R3Q6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc58Q8R3Q6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc58Q8R3Q6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc58Q8R3Q6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc58Q8R3Q6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc58Q8R3Q6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc58Q8R3Q6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc58Q8R3Q6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc58Q8R3Q6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc58Q8R3Q6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc58Q8R3Q6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc58Q8R3Q6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc58Q8R3Q6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc58Q8R3Q6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc58Q8R3Q6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc58Q8R3Q6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc58Q8R3Q6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc58Q8R3Q6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc58Q8R3Q6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc58Q8R3Q6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc58Q8R3Q6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc58Q8R3Q6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc58Q8R3Q6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc58Q8R3Q6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc58Q8R3Q6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc58Q8R3Q6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc58Q8R3Q6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc58Q8R3Q6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc58Q8R3Q6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc58Q8R3Q6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc58Q8R3Q6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc58Q8R3Q6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc58Q8R3Q6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc58Q8R3Q6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc58Q8R3Q6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc58Q8R3Q6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc58Q8R3Q6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc58Q8R3Q6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc58Q8R3Q6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc58Q8R3Q6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc58Q8R3Q6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc58Q8R3Q6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc58Q8R3Q6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc58Q8R3Q6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc58Q8R3Q6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc58Q8R3Q6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc58Q8R3Q6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc58Q8R3Q6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc58Q8R3Q6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc58Q8R3Q6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc58Q8R3Q6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc58Q8R3Q6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc58Q8R3Q6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc58Q8R3Q6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc58Q8R3Q6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc58Q8R3Q6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc58Q8R3Q6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc58Q8R3Q6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc58Q8R3Q6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc58Q8R3Q6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms