Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4T3

Stradb, STE20-related kinase adapter protein beta, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StradbQ8K4T3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
StradbQ8K4T3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
StradbQ8K4T3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
StradbQ8K4T3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
StradbQ8K4T3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
StradbQ8K4T3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
StradbQ8K4T3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
StradbQ8K4T3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
StradbQ8K4T3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
StradbQ8K4T3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
StradbQ8K4T3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
StradbQ8K4T3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
StradbQ8K4T3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
StradbQ8K4T3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
StradbQ8K4T3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
StradbQ8K4T3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
StradbQ8K4T3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
StradbQ8K4T3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
StradbQ8K4T3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
StradbQ8K4T3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
StradbQ8K4T3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
StradbQ8K4T3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
StradbQ8K4T3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
StradbQ8K4T3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
StradbQ8K4T3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
StradbQ8K4T3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
StradbQ8K4T3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
StradbQ8K4T3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
StradbQ8K4T3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
StradbQ8K4T3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
StradbQ8K4T3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
StradbQ8K4T3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
StradbQ8K4T3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
StradbQ8K4T3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
StradbQ8K4T3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
StradbQ8K4T3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
StradbQ8K4T3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
StradbQ8K4T3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
StradbQ8K4T3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
StradbQ8K4T3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
StradbQ8K4T3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
StradbQ8K4T3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
StradbQ8K4T3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
StradbQ8K4T3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
StradbQ8K4T3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
StradbQ8K4T3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
StradbQ8K4T3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
StradbQ8K4T3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
StradbQ8K4T3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
StradbQ8K4T3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
StradbQ8K4T3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
StradbQ8K4T3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
StradbQ8K4T3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
StradbQ8K4T3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
StradbQ8K4T3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
StradbQ8K4T3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
StradbQ8K4T3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
StradbQ8K4T3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
StradbQ8K4T3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
StradbQ8K4T3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
StradbQ8K4T3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
StradbQ8K4T3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
StradbQ8K4T3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
StradbQ8K4T3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
StradbQ8K4T3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
StradbQ8K4T3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
StradbQ8K4T3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
StradbQ8K4T3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
StradbQ8K4T3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
StradbQ8K4T3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
StradbQ8K4T3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
StradbQ8K4T3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
StradbQ8K4T3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
StradbQ8K4T3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
StradbQ8K4T3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
StradbQ8K4T3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
StradbQ8K4T3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
StradbQ8K4T3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
StradbQ8K4T3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
StradbQ8K4T3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
StradbQ8K4T3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
StradbQ8K4T3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
StradbQ8K4T3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
StradbQ8K4T3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
StradbQ8K4T3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
StradbQ8K4T3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
StradbQ8K4T3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
StradbQ8K4T3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
StradbQ8K4T3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
StradbQ8K4T3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
StradbQ8K4T3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
StradbQ8K4T3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
StradbQ8K4T3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
StradbQ8K4T3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
StradbQ8K4T3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
StradbQ8K4T3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
StradbQ8K4T3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
StradbQ8K4T3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
StradbQ8K4T3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
StradbQ8K4T3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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