Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Casc3Q8K3W3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Casc3Q8K3W3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Casc3Q8K3W3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Casc3Q8K3W3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Casc3Q8K3W3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Casc3Q8K3W3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Casc3Q8K3W3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Casc3Q8K3W3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casc3Q8K3W3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casc3Q8K3W3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Casc3Q8K3W3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casc3Q8K3W3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casc3Q8K3W3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casc3Q8K3W3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casc3Q8K3W3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Casc3Q8K3W3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casc3Q8K3W3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casc3Q8K3W3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casc3Q8K3W3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Casc3Q8K3W3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Casc3Q8K3W3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casc3Q8K3W3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Casc3Q8K3W3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Casc3Q8K3W3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Casc3Q8K3W3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casc3Q8K3W3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casc3Q8K3W3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Casc3Q8K3W3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Casc3Q8K3W3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Casc3Q8K3W3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casc3Q8K3W3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casc3Q8K3W3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casc3Q8K3W3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casc3Q8K3W3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casc3Q8K3W3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casc3Q8K3W3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casc3Q8K3W3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Casc3Q8K3W3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casc3Q8K3W3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casc3Q8K3W3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casc3Q8K3W3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casc3Q8K3W3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casc3Q8K3W3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Casc3Q8K3W3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Casc3Q8K3W3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casc3Q8K3W3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casc3Q8K3W3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casc3Q8K3W3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casc3Q8K3W3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casc3Q8K3W3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casc3Q8K3W3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casc3Q8K3W3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casc3Q8K3W3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casc3Q8K3W3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casc3Q8K3W3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casc3Q8K3W3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casc3Q8K3W3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casc3Q8K3W3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Casc3Q8K3W3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Casc3Q8K3W3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Casc3Q8K3W3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casc3Q8K3W3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casc3Q8K3W3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casc3Q8K3W3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casc3Q8K3W3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casc3Q8K3W3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Casc3Q8K3W3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Casc3Q8K3W3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casc3Q8K3W3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casc3Q8K3W3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casc3Q8K3W3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Casc3Q8K3W3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casc3Q8K3W3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Casc3Q8K3W3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casc3Q8K3W3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casc3Q8K3W3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Casc3Q8K3W3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casc3Q8K3W3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casc3Q8K3W3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casc3Q8K3W3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casc3Q8K3W3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casc3Q8K3W3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casc3Q8K3W3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casc3Q8K3W3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casc3Q8K3W3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casc3Q8K3W3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casc3Q8K3W3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casc3Q8K3W3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casc3Q8K3W3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casc3Q8K3W3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casc3Q8K3W3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casc3Q8K3W3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Casc3Q8K3W3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casc3Q8K3W3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casc3Q8K3W3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casc3Q8K3W3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Casc3Q8K3W3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Casc3Q8K3W3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Casc3Q8K3W3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms