Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxn4Q8K3Q3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxn4Q8K3Q3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxn4Q8K3Q3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxn4Q8K3Q3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Foxn4Q8K3Q3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxn4Q8K3Q3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxn4Q8K3Q3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Foxn4Q8K3Q3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Foxn4Q8K3Q3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxn4Q8K3Q3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Foxn4Q8K3Q3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxn4Q8K3Q3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Foxn4Q8K3Q3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Foxn4Q8K3Q3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxn4Q8K3Q3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxn4Q8K3Q3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Foxn4Q8K3Q3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Foxn4Q8K3Q3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Foxn4Q8K3Q3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Foxn4Q8K3Q3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxn4Q8K3Q3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Foxn4Q8K3Q3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxn4Q8K3Q3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxn4Q8K3Q3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxn4Q8K3Q3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Foxn4Q8K3Q3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxn4Q8K3Q3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Foxn4Q8K3Q3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Foxn4Q8K3Q3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Foxn4Q8K3Q3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Foxn4Q8K3Q3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxn4Q8K3Q3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Foxn4Q8K3Q3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Foxn4Q8K3Q3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Foxn4Q8K3Q3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxn4Q8K3Q3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxn4Q8K3Q3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxn4Q8K3Q3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Foxn4Q8K3Q3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Foxn4Q8K3Q3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Foxn4Q8K3Q3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxn4Q8K3Q3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxn4Q8K3Q3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxn4Q8K3Q3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxn4Q8K3Q3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxn4Q8K3Q3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxn4Q8K3Q3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxn4Q8K3Q3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxn4Q8K3Q3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxn4Q8K3Q3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxn4Q8K3Q3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxn4Q8K3Q3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxn4Q8K3Q3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxn4Q8K3Q3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxn4Q8K3Q3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxn4Q8K3Q3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Foxn4Q8K3Q3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Foxn4Q8K3Q3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxn4Q8K3Q3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxn4Q8K3Q3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxn4Q8K3Q3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxn4Q8K3Q3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxn4Q8K3Q3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxn4Q8K3Q3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxn4Q8K3Q3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Foxn4Q8K3Q3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxn4Q8K3Q3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxn4Q8K3Q3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxn4Q8K3Q3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxn4Q8K3Q3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxn4Q8K3Q3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Foxn4Q8K3Q3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Foxn4Q8K3Q3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Foxn4Q8K3Q3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxn4Q8K3Q3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxn4Q8K3Q3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Foxn4Q8K3Q3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxn4Q8K3Q3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxn4Q8K3Q3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxn4Q8K3Q3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxn4Q8K3Q3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxn4Q8K3Q3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxn4Q8K3Q3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxn4Q8K3Q3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxn4Q8K3Q3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Foxn4Q8K3Q3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Foxn4Q8K3Q3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Foxn4Q8K3Q3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxn4Q8K3Q3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxn4Q8K3Q3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxn4Q8K3Q3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxn4Q8K3Q3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxn4Q8K3Q3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxn4Q8K3Q3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxn4Q8K3Q3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxn4Q8K3Q3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxn4Q8K3Q3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxn4Q8K3Q3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxn4Q8K3Q3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1143.4 ms