Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H7

Slc45a3, Solute carrier family 45 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a3Q8K0H7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc45a3Q8K0H7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc45a3Q8K0H7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc45a3Q8K0H7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc45a3Q8K0H7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc45a3Q8K0H7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc45a3Q8K0H7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc45a3Q8K0H7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc45a3Q8K0H7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc45a3Q8K0H7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc45a3Q8K0H7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc45a3Q8K0H7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc45a3Q8K0H7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc45a3Q8K0H7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc45a3Q8K0H7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc45a3Q8K0H7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc45a3Q8K0H7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc45a3Q8K0H7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc45a3Q8K0H7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc45a3Q8K0H7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc45a3Q8K0H7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc45a3Q8K0H7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc45a3Q8K0H7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc45a3Q8K0H7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc45a3Q8K0H7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc45a3Q8K0H7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc45a3Q8K0H7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc45a3Q8K0H7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc45a3Q8K0H7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc45a3Q8K0H7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc45a3Q8K0H7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc45a3Q8K0H7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc45a3Q8K0H7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc45a3Q8K0H7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Slc45a3Q8K0H7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc45a3Q8K0H7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc45a3Q8K0H7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc45a3Q8K0H7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Slc45a3Q8K0H7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc45a3Q8K0H7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slc45a3Q8K0H7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Slc45a3Q8K0H7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc45a3Q8K0H7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc45a3Q8K0H7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc45a3Q8K0H7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc45a3Q8K0H7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc45a3Q8K0H7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc45a3Q8K0H7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc45a3Q8K0H7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slc45a3Q8K0H7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc45a3Q8K0H7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slc45a3Q8K0H7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc45a3Q8K0H7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Slc45a3Q8K0H7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc45a3Q8K0H7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slc45a3Q8K0H7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Slc45a3Q8K0H7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc45a3Q8K0H7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Slc45a3Q8K0H7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Slc45a3Q8K0H7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc45a3Q8K0H7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc45a3Q8K0H7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc45a3Q8K0H7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc45a3Q8K0H7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc45a3Q8K0H7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc45a3Q8K0H7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc45a3Q8K0H7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc45a3Q8K0H7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc45a3Q8K0H7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc45a3Q8K0H7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc45a3Q8K0H7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc45a3Q8K0H7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc45a3Q8K0H7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc45a3Q8K0H7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc45a3Q8K0H7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc45a3Q8K0H7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc45a3Q8K0H7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc45a3Q8K0H7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc45a3Q8K0H7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc45a3Q8K0H7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc45a3Q8K0H7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc45a3Q8K0H7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc45a3Q8K0H7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc45a3Q8K0H7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc45a3Q8K0H7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc45a3Q8K0H7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc45a3Q8K0H7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc45a3Q8K0H7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc45a3Q8K0H7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc45a3Q8K0H7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc45a3Q8K0H7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc45a3Q8K0H7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc45a3Q8K0H7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc45a3Q8K0H7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc45a3Q8K0H7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc45a3Q8K0H7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc45a3Q8K0H7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc45a3Q8K0H7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc45a3Q8K0H7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc45a3Q8K0H7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms