Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D0

Cdk17, Cyclin-dependent kinase 17, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk17Q8K0D0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdk17Q8K0D0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cdk17Q8K0D0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdk17Q8K0D0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk17Q8K0D0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk17Q8K0D0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk17Q8K0D0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdk17Q8K0D0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cdk17Q8K0D0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk17Q8K0D0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk17Q8K0D0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk17Q8K0D0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdk17Q8K0D0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdk17Q8K0D0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdk17Q8K0D0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdk17Q8K0D0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdk17Q8K0D0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdk17Q8K0D0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdk17Q8K0D0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdk17Q8K0D0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdk17Q8K0D0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cdk17Q8K0D0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdk17Q8K0D0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdk17Q8K0D0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdk17Q8K0D0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdk17Q8K0D0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdk17Q8K0D0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdk17Q8K0D0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdk17Q8K0D0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdk17Q8K0D0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdk17Q8K0D0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cdk17Q8K0D0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk17Q8K0D0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk17Q8K0D0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk17Q8K0D0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk17Q8K0D0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk17Q8K0D0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk17Q8K0D0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdk17Q8K0D0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk17Q8K0D0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk17Q8K0D0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk17Q8K0D0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk17Q8K0D0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk17Q8K0D0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk17Q8K0D0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk17Q8K0D0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk17Q8K0D0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdk17Q8K0D0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdk17Q8K0D0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdk17Q8K0D0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdk17Q8K0D0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdk17Q8K0D0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cdk17Q8K0D0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdk17Q8K0D0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdk17Q8K0D0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cdk17Q8K0D0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdk17Q8K0D0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdk17Q8K0D0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdk17Q8K0D0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdk17Q8K0D0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdk17Q8K0D0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdk17Q8K0D0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdk17Q8K0D0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdk17Q8K0D0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cdk17Q8K0D0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk17Q8K0D0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk17Q8K0D0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cdk17Q8K0D0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cdk17Q8K0D0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdk17Q8K0D0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cdk17Q8K0D0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cdk17Q8K0D0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdk17Q8K0D0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdk17Q8K0D0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cdk17Q8K0D0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdk17Q8K0D0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdk17Q8K0D0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk17Q8K0D0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdk17Q8K0D0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdk17Q8K0D0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdk17Q8K0D0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk17Q8K0D0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdk17Q8K0D0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cdk17Q8K0D0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdk17Q8K0D0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdk17Q8K0D0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk17Q8K0D0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdk17Q8K0D0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdk17Q8K0D0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdk17Q8K0D0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdk17Q8K0D0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdk17Q8K0D0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdk17Q8K0D0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdk17Q8K0D0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdk17Q8K0D0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdk17Q8K0D0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdk17Q8K0D0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdk17Q8K0D0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdk17Q8K0D0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdk17Q8K0D0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms