Protein–RNA interactions for Protein: Q8C817

Tmem200a, Transmembrane protein 200A, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200aQ8C817 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem200aQ8C817 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem200aQ8C817 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tmem200aQ8C817 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem200aQ8C817 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmem200aQ8C817 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmem200aQ8C817 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem200aQ8C817 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmem200aQ8C817 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem200aQ8C817 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem200aQ8C817 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmem200aQ8C817 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem200aQ8C817 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmem200aQ8C817 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem200aQ8C817 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem200aQ8C817 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem200aQ8C817 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem200aQ8C817 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmem200aQ8C817 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem200aQ8C817 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem200aQ8C817 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem200aQ8C817 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem200aQ8C817 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem200aQ8C817 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem200aQ8C817 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem200aQ8C817 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem200aQ8C817 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem200aQ8C817 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem200aQ8C817 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem200aQ8C817 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem200aQ8C817 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem200aQ8C817 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem200aQ8C817 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem200aQ8C817 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem200aQ8C817 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem200aQ8C817 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmem200aQ8C817 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem200aQ8C817 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem200aQ8C817 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem200aQ8C817 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem200aQ8C817 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem200aQ8C817 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem200aQ8C817 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem200aQ8C817 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem200aQ8C817 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem200aQ8C817 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem200aQ8C817 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem200aQ8C817 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem200aQ8C817 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem200aQ8C817 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem200aQ8C817 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem200aQ8C817 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem200aQ8C817 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem200aQ8C817 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem200aQ8C817 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmem200aQ8C817 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmem200aQ8C817 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem200aQ8C817 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem200aQ8C817 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem200aQ8C817 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem200aQ8C817 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem200aQ8C817 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmem200aQ8C817 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem200aQ8C817 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmem200aQ8C817 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem200aQ8C817 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem200aQ8C817 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem200aQ8C817 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem200aQ8C817 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem200aQ8C817 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem200aQ8C817 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem200aQ8C817 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem200aQ8C817 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem200aQ8C817 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem200aQ8C817 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem200aQ8C817 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem200aQ8C817 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmem200aQ8C817 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmem200aQ8C817 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmem200aQ8C817 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmem200aQ8C817 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem200aQ8C817 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmem200aQ8C817 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem200aQ8C817 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmem200aQ8C817 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem200aQ8C817 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem200aQ8C817 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem200aQ8C817 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem200aQ8C817 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem200aQ8C817 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem200aQ8C817 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem200aQ8C817 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem200aQ8C817 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem200aQ8C817 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem200aQ8C817 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem200aQ8C817 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem200aQ8C817 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem200aQ8C817 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem200aQ8C817 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem200aQ8C817 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms