Protein–RNA interactions for Protein: Q8C262

Irgc, Interferon-inducible GTPase 5, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IrgcQ8C262 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IrgcQ8C262 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IrgcQ8C262 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IrgcQ8C262 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IrgcQ8C262 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IrgcQ8C262 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IrgcQ8C262 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IrgcQ8C262 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IrgcQ8C262 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IrgcQ8C262 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IrgcQ8C262 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IrgcQ8C262 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IrgcQ8C262 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IrgcQ8C262 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IrgcQ8C262 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IrgcQ8C262 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IrgcQ8C262 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IrgcQ8C262 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IrgcQ8C262 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IrgcQ8C262 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IrgcQ8C262 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IrgcQ8C262 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IrgcQ8C262 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IrgcQ8C262 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IrgcQ8C262 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IrgcQ8C262 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IrgcQ8C262 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IrgcQ8C262 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IrgcQ8C262 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IrgcQ8C262 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IrgcQ8C262 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IrgcQ8C262 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IrgcQ8C262 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IrgcQ8C262 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IrgcQ8C262 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IrgcQ8C262 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IrgcQ8C262 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IrgcQ8C262 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IrgcQ8C262 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IrgcQ8C262 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IrgcQ8C262 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IrgcQ8C262 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IrgcQ8C262 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IrgcQ8C262 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IrgcQ8C262 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IrgcQ8C262 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IrgcQ8C262 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IrgcQ8C262 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IrgcQ8C262 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IrgcQ8C262 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IrgcQ8C262 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IrgcQ8C262 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IrgcQ8C262 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IrgcQ8C262 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IrgcQ8C262 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IrgcQ8C262 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IrgcQ8C262 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IrgcQ8C262 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
IrgcQ8C262 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IrgcQ8C262 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IrgcQ8C262 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IrgcQ8C262 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IrgcQ8C262 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IrgcQ8C262 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IrgcQ8C262 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IrgcQ8C262 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IrgcQ8C262 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IrgcQ8C262 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IrgcQ8C262 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IrgcQ8C262 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IrgcQ8C262 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IrgcQ8C262 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IrgcQ8C262 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IrgcQ8C262 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IrgcQ8C262 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IrgcQ8C262 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IrgcQ8C262 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IrgcQ8C262 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IrgcQ8C262 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IrgcQ8C262 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IrgcQ8C262 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IrgcQ8C262 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IrgcQ8C262 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IrgcQ8C262 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IrgcQ8C262 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IrgcQ8C262 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IrgcQ8C262 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IrgcQ8C262 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IrgcQ8C262 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IrgcQ8C262 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IrgcQ8C262 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IrgcQ8C262 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IrgcQ8C262 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IrgcQ8C262 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IrgcQ8C262 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IrgcQ8C262 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IrgcQ8C262 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IrgcQ8C262 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IrgcQ8C262 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IrgcQ8C262 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms