Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx16Q8C080 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx16Q8C080 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Snx16Q8C080 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Snx16Q8C080 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Snx16Q8C080 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Snx16Q8C080 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx16Q8C080 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Snx16Q8C080 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx16Q8C080 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx16Q8C080 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx16Q8C080 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx16Q8C080 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx16Q8C080 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx16Q8C080 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx16Q8C080 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx16Q8C080 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx16Q8C080 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx16Q8C080 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx16Q8C080 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx16Q8C080 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx16Q8C080 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx16Q8C080 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Snx16Q8C080 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx16Q8C080 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx16Q8C080 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx16Q8C080 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx16Q8C080 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx16Q8C080 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snx16Q8C080 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snx16Q8C080 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx16Q8C080 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx16Q8C080 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx16Q8C080 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx16Q8C080 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx16Q8C080 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx16Q8C080 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx16Q8C080 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx16Q8C080 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx16Q8C080 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Snx16Q8C080 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx16Q8C080 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Snx16Q8C080 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx16Q8C080 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Snx16Q8C080 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Snx16Q8C080 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx16Q8C080 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx16Q8C080 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx16Q8C080 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx16Q8C080 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Snx16Q8C080 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx16Q8C080 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx16Q8C080 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx16Q8C080 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snx16Q8C080 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snx16Q8C080 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snx16Q8C080 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx16Q8C080 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx16Q8C080 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx16Q8C080 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx16Q8C080 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx16Q8C080 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx16Q8C080 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx16Q8C080 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx16Q8C080 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx16Q8C080 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx16Q8C080 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx16Q8C080 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx16Q8C080 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx16Q8C080 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx16Q8C080 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx16Q8C080 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx16Q8C080 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx16Q8C080 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx16Q8C080 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx16Q8C080 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx16Q8C080 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx16Q8C080 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Snx16Q8C080 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx16Q8C080 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx16Q8C080 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx16Q8C080 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx16Q8C080 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx16Q8C080 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx16Q8C080 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx16Q8C080 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx16Q8C080 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx16Q8C080 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Snx16Q8C080 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx16Q8C080 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx16Q8C080 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Snx16Q8C080 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx16Q8C080 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx16Q8C080 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Snx16Q8C080 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Snx16Q8C080 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx16Q8C080 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx16Q8C080 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx16Q8C080 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx16Q8C080 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
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