Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Iffo1Q8BXL9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Iffo1Q8BXL9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Iffo1Q8BXL9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Iffo1Q8BXL9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Iffo1Q8BXL9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Iffo1Q8BXL9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Iffo1Q8BXL9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Iffo1Q8BXL9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Iffo1Q8BXL9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Iffo1Q8BXL9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Iffo1Q8BXL9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Iffo1Q8BXL9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Iffo1Q8BXL9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Iffo1Q8BXL9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Iffo1Q8BXL9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Iffo1Q8BXL9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Iffo1Q8BXL9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Iffo1Q8BXL9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Iffo1Q8BXL9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Iffo1Q8BXL9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Iffo1Q8BXL9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Iffo1Q8BXL9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Iffo1Q8BXL9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Iffo1Q8BXL9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Iffo1Q8BXL9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Iffo1Q8BXL9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Iffo1Q8BXL9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Iffo1Q8BXL9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Iffo1Q8BXL9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Iffo1Q8BXL9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Iffo1Q8BXL9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Iffo1Q8BXL9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Iffo1Q8BXL9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Iffo1Q8BXL9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Iffo1Q8BXL9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Iffo1Q8BXL9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Iffo1Q8BXL9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Iffo1Q8BXL9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Iffo1Q8BXL9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Iffo1Q8BXL9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Iffo1Q8BXL9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Iffo1Q8BXL9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Iffo1Q8BXL9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Iffo1Q8BXL9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Iffo1Q8BXL9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Iffo1Q8BXL9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Iffo1Q8BXL9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Iffo1Q8BXL9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Iffo1Q8BXL9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Iffo1Q8BXL9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Iffo1Q8BXL9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Iffo1Q8BXL9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Iffo1Q8BXL9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Iffo1Q8BXL9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Iffo1Q8BXL9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Iffo1Q8BXL9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Iffo1Q8BXL9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Iffo1Q8BXL9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Iffo1Q8BXL9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Iffo1Q8BXL9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Iffo1Q8BXL9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Iffo1Q8BXL9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Iffo1Q8BXL9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Iffo1Q8BXL9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Iffo1Q8BXL9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Iffo1Q8BXL9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Iffo1Q8BXL9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Iffo1Q8BXL9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Iffo1Q8BXL9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Iffo1Q8BXL9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Iffo1Q8BXL9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Iffo1Q8BXL9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Iffo1Q8BXL9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Iffo1Q8BXL9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Iffo1Q8BXL9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Iffo1Q8BXL9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Iffo1Q8BXL9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Iffo1Q8BXL9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Iffo1Q8BXL9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Iffo1Q8BXL9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Iffo1Q8BXL9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Iffo1Q8BXL9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Iffo1Q8BXL9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Iffo1Q8BXL9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Iffo1Q8BXL9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Iffo1Q8BXL9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Iffo1Q8BXL9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Iffo1Q8BXL9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Iffo1Q8BXL9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Iffo1Q8BXL9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Iffo1Q8BXL9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Iffo1Q8BXL9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Iffo1Q8BXL9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Iffo1Q8BXL9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Iffo1Q8BXL9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Iffo1Q8BXL9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Iffo1Q8BXL9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Iffo1Q8BXL9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Iffo1Q8BXL9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms