Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Arfrp1Q8BXL7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfrp1Q8BXL7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfrp1Q8BXL7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfrp1Q8BXL7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Arfrp1Q8BXL7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Arfrp1Q8BXL7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arfrp1Q8BXL7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arfrp1Q8BXL7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arfrp1Q8BXL7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Arfrp1Q8BXL7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arfrp1Q8BXL7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arfrp1Q8BXL7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arfrp1Q8BXL7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfrp1Q8BXL7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfrp1Q8BXL7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfrp1Q8BXL7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arfrp1Q8BXL7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arfrp1Q8BXL7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arfrp1Q8BXL7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arfrp1Q8BXL7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arfrp1Q8BXL7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfrp1Q8BXL7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfrp1Q8BXL7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arfrp1Q8BXL7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfrp1Q8BXL7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfrp1Q8BXL7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arfrp1Q8BXL7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfrp1Q8BXL7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arfrp1Q8BXL7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfrp1Q8BXL7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arfrp1Q8BXL7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arfrp1Q8BXL7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arfrp1Q8BXL7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arfrp1Q8BXL7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arfrp1Q8BXL7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arfrp1Q8BXL7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Arfrp1Q8BXL7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arfrp1Q8BXL7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arfrp1Q8BXL7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfrp1Q8BXL7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfrp1Q8BXL7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arfrp1Q8BXL7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arfrp1Q8BXL7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arfrp1Q8BXL7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arfrp1Q8BXL7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arfrp1Q8BXL7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arfrp1Q8BXL7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arfrp1Q8BXL7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arfrp1Q8BXL7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfrp1Q8BXL7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfrp1Q8BXL7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arfrp1Q8BXL7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arfrp1Q8BXL7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Arfrp1Q8BXL7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arfrp1Q8BXL7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arfrp1Q8BXL7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arfrp1Q8BXL7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arfrp1Q8BXL7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arfrp1Q8BXL7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arfrp1Q8BXL7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Arfrp1Q8BXL7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arfrp1Q8BXL7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arfrp1Q8BXL7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arfrp1Q8BXL7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arfrp1Q8BXL7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arfrp1Q8BXL7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Arfrp1Q8BXL7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arfrp1Q8BXL7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arfrp1Q8BXL7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arfrp1Q8BXL7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arfrp1Q8BXL7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Arfrp1Q8BXL7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arfrp1Q8BXL7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arfrp1Q8BXL7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arfrp1Q8BXL7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arfrp1Q8BXL7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arfrp1Q8BXL7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arfrp1Q8BXL7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Arfrp1Q8BXL7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arfrp1Q8BXL7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arfrp1Q8BXL7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arfrp1Q8BXL7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arfrp1Q8BXL7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arfrp1Q8BXL7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arfrp1Q8BXL7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arfrp1Q8BXL7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arfrp1Q8BXL7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arfrp1Q8BXL7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arfrp1Q8BXL7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfrp1Q8BXL7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfrp1Q8BXL7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfrp1Q8BXL7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfrp1Q8BXL7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfrp1Q8BXL7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfrp1Q8BXL7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfrp1Q8BXL7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfrp1Q8BXL7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Arfrp1Q8BXL7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Arfrp1Q8BXL7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms