Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS3

Gbp9, Guanylate-binding protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp9Q8BTS3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25,79■■□□□ 1,72
Gbp9Q8BTS3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Gbp9Q8BTS3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Gbp9Q8BTS3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Gbp9Q8BTS3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Gbp9Q8BTS3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Gbp9Q8BTS3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Gbp9Q8BTS3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Gbp9Q8BTS3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Gbp9Q8BTS3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Gbp9Q8BTS3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25,69■■□□□ 1,7
Gbp9Q8BTS3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Gbp9Q8BTS3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Gbp9Q8BTS3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Gbp9Q8BTS3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25,68■■□□□ 1,7
Gbp9Q8BTS3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Gbp9Q8BTS3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Gbp9Q8BTS3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Gbp9Q8BTS3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Gbp9Q8BTS3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Gbp9Q8BTS3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
Gbp9Q8BTS3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Gbp9Q8BTS3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Gbp9Q8BTS3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Gbp9Q8BTS3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Gbp9Q8BTS3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Gbp9Q8BTS3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Gbp9Q8BTS3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Gbp9Q8BTS3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Gbp9Q8BTS3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Gbp9Q8BTS3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Gbp9Q8BTS3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Gbp9Q8BTS3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Gbp9Q8BTS3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Gbp9Q8BTS3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Gbp9Q8BTS3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Gbp9Q8BTS3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Gbp9Q8BTS3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Gbp9Q8BTS3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Gbp9Q8BTS3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Gbp9Q8BTS3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Gbp9Q8BTS3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Gbp9Q8BTS3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Gbp9Q8BTS3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Gbp9Q8BTS3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25,39■■□□□ 1,65
Gbp9Q8BTS3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Gbp9Q8BTS3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Gbp9Q8BTS3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,36■■□□□ 1,65
Gbp9Q8BTS3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25,35■■□□□ 1,65
Gbp9Q8BTS3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Gbp9Q8BTS3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Gbp9Q8BTS3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Gbp9Q8BTS3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Gbp9Q8BTS3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25,33■■□□□ 1,65
Gbp9Q8BTS3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25,32■■□□□ 1,64
Gbp9Q8BTS3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Gbp9Q8BTS3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Gbp9Q8BTS3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Gbp9Q8BTS3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Gbp9Q8BTS3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Gbp9Q8BTS3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Gbp9Q8BTS3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Gbp9Q8BTS3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Gbp9Q8BTS3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Gbp9Q8BTS3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Gbp9Q8BTS3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25,26■■□□□ 1,63
Gbp9Q8BTS3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Gbp9Q8BTS3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Gbp9Q8BTS3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Gbp9Q8BTS3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Gbp9Q8BTS3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Gbp9Q8BTS3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Gbp9Q8BTS3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Gbp9Q8BTS3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Gbp9Q8BTS3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Gbp9Q8BTS3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Gbp9Q8BTS3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Gbp9Q8BTS3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Gbp9Q8BTS3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25,14■■□□□ 1,61
Gbp9Q8BTS3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Gbp9Q8BTS3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Gbp9Q8BTS3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Gbp9Q8BTS3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Gbp9Q8BTS3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Gbp9Q8BTS3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Gbp9Q8BTS3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Gbp9Q8BTS3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Gbp9Q8BTS3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Gbp9Q8BTS3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Gbp9Q8BTS3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Gbp9Q8BTS3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Gbp9Q8BTS3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Gbp9Q8BTS3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25,03■■□□□ 1,6
Gbp9Q8BTS3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,02■■□□□ 1,6
Gbp9Q8BTS3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Gbp9Q8BTS3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Gbp9Q8BTS3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Gbp9Q8BTS3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24,99■■□□□ 1,59
Gbp9Q8BTS3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Gbp9Q8BTS3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,7 ms