Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMP6

Acbd3, Golgi resident protein GCP60, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd3Q8BMP6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Acbd3Q8BMP6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Acbd3Q8BMP6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Acbd3Q8BMP6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Acbd3Q8BMP6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Acbd3Q8BMP6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Acbd3Q8BMP6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Acbd3Q8BMP6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Acbd3Q8BMP6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Acbd3Q8BMP6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Acbd3Q8BMP6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Acbd3Q8BMP6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Acbd3Q8BMP6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Acbd3Q8BMP6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Acbd3Q8BMP6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Acbd3Q8BMP6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Acbd3Q8BMP6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Acbd3Q8BMP6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Acbd3Q8BMP6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Acbd3Q8BMP6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Acbd3Q8BMP6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Acbd3Q8BMP6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Acbd3Q8BMP6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Acbd3Q8BMP6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Acbd3Q8BMP6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Acbd3Q8BMP6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Acbd3Q8BMP6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Acbd3Q8BMP6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Acbd3Q8BMP6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Acbd3Q8BMP6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Acbd3Q8BMP6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Acbd3Q8BMP6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Acbd3Q8BMP6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Acbd3Q8BMP6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Acbd3Q8BMP6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Acbd3Q8BMP6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Acbd3Q8BMP6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Acbd3Q8BMP6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Acbd3Q8BMP6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Acbd3Q8BMP6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Acbd3Q8BMP6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Acbd3Q8BMP6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Acbd3Q8BMP6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Acbd3Q8BMP6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Acbd3Q8BMP6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Acbd3Q8BMP6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Acbd3Q8BMP6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Acbd3Q8BMP6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Acbd3Q8BMP6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Acbd3Q8BMP6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Acbd3Q8BMP6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Acbd3Q8BMP6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Acbd3Q8BMP6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Acbd3Q8BMP6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Acbd3Q8BMP6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Acbd3Q8BMP6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Acbd3Q8BMP6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Acbd3Q8BMP6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Acbd3Q8BMP6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Acbd3Q8BMP6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Acbd3Q8BMP6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Acbd3Q8BMP6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Acbd3Q8BMP6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Acbd3Q8BMP6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Acbd3Q8BMP6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Acbd3Q8BMP6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Acbd3Q8BMP6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Acbd3Q8BMP6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Acbd3Q8BMP6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Acbd3Q8BMP6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Acbd3Q8BMP6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Acbd3Q8BMP6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Acbd3Q8BMP6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Acbd3Q8BMP6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Acbd3Q8BMP6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Acbd3Q8BMP6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Acbd3Q8BMP6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Acbd3Q8BMP6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Acbd3Q8BMP6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Acbd3Q8BMP6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Acbd3Q8BMP6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Acbd3Q8BMP6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Acbd3Q8BMP6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Acbd3Q8BMP6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Acbd3Q8BMP6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Acbd3Q8BMP6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Acbd3Q8BMP6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Acbd3Q8BMP6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Acbd3Q8BMP6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Acbd3Q8BMP6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Acbd3Q8BMP6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Acbd3Q8BMP6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Acbd3Q8BMP6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Acbd3Q8BMP6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Acbd3Q8BMP6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Acbd3Q8BMP6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Acbd3Q8BMP6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Acbd3Q8BMP6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Acbd3Q8BMP6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Acbd3Q8BMP6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms