Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gtf3c2Q8BL74 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Gtf3c2Q8BL74 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gtf3c2Q8BL74 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Gtf3c2Q8BL74 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Gtf3c2Q8BL74 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gtf3c2Q8BL74 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gtf3c2Q8BL74 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gtf3c2Q8BL74 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gtf3c2Q8BL74 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gtf3c2Q8BL74 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gtf3c2Q8BL74 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gtf3c2Q8BL74 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gtf3c2Q8BL74 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gtf3c2Q8BL74 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gtf3c2Q8BL74 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gtf3c2Q8BL74 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gtf3c2Q8BL74 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gtf3c2Q8BL74 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gtf3c2Q8BL74 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gtf3c2Q8BL74 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gtf3c2Q8BL74 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Gtf3c2Q8BL74 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gtf3c2Q8BL74 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gtf3c2Q8BL74 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gtf3c2Q8BL74 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gtf3c2Q8BL74 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gtf3c2Q8BL74 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gtf3c2Q8BL74 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Gtf3c2Q8BL74 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gtf3c2Q8BL74 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Gtf3c2Q8BL74 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Gtf3c2Q8BL74 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gtf3c2Q8BL74 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gtf3c2Q8BL74 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gtf3c2Q8BL74 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gtf3c2Q8BL74 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gtf3c2Q8BL74 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gtf3c2Q8BL74 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gtf3c2Q8BL74 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Gtf3c2Q8BL74 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gtf3c2Q8BL74 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gtf3c2Q8BL74 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gtf3c2Q8BL74 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gtf3c2Q8BL74 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gtf3c2Q8BL74 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gtf3c2Q8BL74 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gtf3c2Q8BL74 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gtf3c2Q8BL74 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gtf3c2Q8BL74 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtf3c2Q8BL74 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtf3c2Q8BL74 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gtf3c2Q8BL74 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Gtf3c2Q8BL74 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gtf3c2Q8BL74 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gtf3c2Q8BL74 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gtf3c2Q8BL74 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gtf3c2Q8BL74 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gtf3c2Q8BL74 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gtf3c2Q8BL74 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gtf3c2Q8BL74 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gtf3c2Q8BL74 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gtf3c2Q8BL74 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gtf3c2Q8BL74 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gtf3c2Q8BL74 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gtf3c2Q8BL74 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Gtf3c2Q8BL74 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Gtf3c2Q8BL74 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Gtf3c2Q8BL74 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Gtf3c2Q8BL74 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gtf3c2Q8BL74 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Gtf3c2Q8BL74 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gtf3c2Q8BL74 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Gtf3c2Q8BL74 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gtf3c2Q8BL74 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Gtf3c2Q8BL74 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gtf3c2Q8BL74 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gtf3c2Q8BL74 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf3c2Q8BL74 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gtf3c2Q8BL74 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gtf3c2Q8BL74 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf3c2Q8BL74 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf3c2Q8BL74 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf3c2Q8BL74 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf3c2Q8BL74 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gtf3c2Q8BL74 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gtf3c2Q8BL74 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gtf3c2Q8BL74 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gtf3c2Q8BL74 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gtf3c2Q8BL74 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gtf3c2Q8BL74 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtf3c2Q8BL74 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gtf3c2Q8BL74 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gtf3c2Q8BL74 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtf3c2Q8BL74 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtf3c2Q8BL74 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtf3c2Q8BL74 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtf3c2Q8BL74 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtf3c2Q8BL74 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtf3c2Q8BL74 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms