Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tspan9Q8BJU2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tspan9Q8BJU2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tspan9Q8BJU2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tspan9Q8BJU2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tspan9Q8BJU2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tspan9Q8BJU2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tspan9Q8BJU2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan9Q8BJU2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tspan9Q8BJU2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tspan9Q8BJU2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan9Q8BJU2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tspan9Q8BJU2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tspan9Q8BJU2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tspan9Q8BJU2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tspan9Q8BJU2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tspan9Q8BJU2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tspan9Q8BJU2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tspan9Q8BJU2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tspan9Q8BJU2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tspan9Q8BJU2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tspan9Q8BJU2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tspan9Q8BJU2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tspan9Q8BJU2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan9Q8BJU2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan9Q8BJU2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan9Q8BJU2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan9Q8BJU2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tspan9Q8BJU2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tspan9Q8BJU2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan9Q8BJU2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan9Q8BJU2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan9Q8BJU2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan9Q8BJU2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan9Q8BJU2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan9Q8BJU2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan9Q8BJU2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan9Q8BJU2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan9Q8BJU2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tspan9Q8BJU2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan9Q8BJU2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan9Q8BJU2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tspan9Q8BJU2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan9Q8BJU2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan9Q8BJU2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan9Q8BJU2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan9Q8BJU2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan9Q8BJU2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tspan9Q8BJU2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan9Q8BJU2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan9Q8BJU2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan9Q8BJU2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan9Q8BJU2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan9Q8BJU2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan9Q8BJU2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan9Q8BJU2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan9Q8BJU2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan9Q8BJU2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan9Q8BJU2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan9Q8BJU2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan9Q8BJU2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tspan9Q8BJU2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan9Q8BJU2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan9Q8BJU2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan9Q8BJU2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan9Q8BJU2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan9Q8BJU2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan9Q8BJU2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan9Q8BJU2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan9Q8BJU2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan9Q8BJU2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan9Q8BJU2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan9Q8BJU2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan9Q8BJU2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan9Q8BJU2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan9Q8BJU2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan9Q8BJU2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan9Q8BJU2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan9Q8BJU2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tspan9Q8BJU2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan9Q8BJU2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan9Q8BJU2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan9Q8BJU2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan9Q8BJU2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan9Q8BJU2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan9Q8BJU2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan9Q8BJU2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan9Q8BJU2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan9Q8BJU2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan9Q8BJU2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan9Q8BJU2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan9Q8BJU2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan9Q8BJU2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan9Q8BJU2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan9Q8BJU2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan9Q8BJU2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan9Q8BJU2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan9Q8BJU2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan9Q8BJU2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan9Q8BJU2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms