Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Rufy1Q8BIJ7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rufy1Q8BIJ7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rufy1Q8BIJ7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rufy1Q8BIJ7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rufy1Q8BIJ7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rufy1Q8BIJ7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Rufy1Q8BIJ7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rufy1Q8BIJ7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rufy1Q8BIJ7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rufy1Q8BIJ7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rufy1Q8BIJ7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rufy1Q8BIJ7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rufy1Q8BIJ7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rufy1Q8BIJ7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rufy1Q8BIJ7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rufy1Q8BIJ7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rufy1Q8BIJ7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rufy1Q8BIJ7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rufy1Q8BIJ7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rufy1Q8BIJ7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rufy1Q8BIJ7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rufy1Q8BIJ7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rufy1Q8BIJ7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rufy1Q8BIJ7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rufy1Q8BIJ7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rufy1Q8BIJ7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rufy1Q8BIJ7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rufy1Q8BIJ7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rufy1Q8BIJ7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rufy1Q8BIJ7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rufy1Q8BIJ7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rufy1Q8BIJ7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rufy1Q8BIJ7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rufy1Q8BIJ7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rufy1Q8BIJ7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rufy1Q8BIJ7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rufy1Q8BIJ7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rufy1Q8BIJ7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rufy1Q8BIJ7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rufy1Q8BIJ7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rufy1Q8BIJ7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rufy1Q8BIJ7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rufy1Q8BIJ7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rufy1Q8BIJ7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rufy1Q8BIJ7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rufy1Q8BIJ7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rufy1Q8BIJ7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rufy1Q8BIJ7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rufy1Q8BIJ7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Rufy1Q8BIJ7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rufy1Q8BIJ7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rufy1Q8BIJ7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rufy1Q8BIJ7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rufy1Q8BIJ7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rufy1Q8BIJ7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rufy1Q8BIJ7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rufy1Q8BIJ7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rufy1Q8BIJ7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rufy1Q8BIJ7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rufy1Q8BIJ7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rufy1Q8BIJ7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rufy1Q8BIJ7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rufy1Q8BIJ7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rufy1Q8BIJ7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rufy1Q8BIJ7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rufy1Q8BIJ7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rufy1Q8BIJ7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rufy1Q8BIJ7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rufy1Q8BIJ7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Rufy1Q8BIJ7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rufy1Q8BIJ7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rufy1Q8BIJ7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rufy1Q8BIJ7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rufy1Q8BIJ7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rufy1Q8BIJ7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rufy1Q8BIJ7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rufy1Q8BIJ7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Rufy1Q8BIJ7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rufy1Q8BIJ7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rufy1Q8BIJ7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Rufy1Q8BIJ7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rufy1Q8BIJ7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rufy1Q8BIJ7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rufy1Q8BIJ7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rufy1Q8BIJ7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rufy1Q8BIJ7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rufy1Q8BIJ7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Rufy1Q8BIJ7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rufy1Q8BIJ7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rufy1Q8BIJ7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rufy1Q8BIJ7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rufy1Q8BIJ7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rufy1Q8BIJ7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rufy1Q8BIJ7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rufy1Q8BIJ7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms