Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH02

Tor4a, Torsin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor4aQ8BH02 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tor4aQ8BH02 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tor4aQ8BH02 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tor4aQ8BH02 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tor4aQ8BH02 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tor4aQ8BH02 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tor4aQ8BH02 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tor4aQ8BH02 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tor4aQ8BH02 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tor4aQ8BH02 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Tor4aQ8BH02 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tor4aQ8BH02 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tor4aQ8BH02 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tor4aQ8BH02 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tor4aQ8BH02 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tor4aQ8BH02 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tor4aQ8BH02 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tor4aQ8BH02 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tor4aQ8BH02 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tor4aQ8BH02 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tor4aQ8BH02 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Tor4aQ8BH02 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tor4aQ8BH02 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Tor4aQ8BH02 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Tor4aQ8BH02 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tor4aQ8BH02 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tor4aQ8BH02 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Tor4aQ8BH02 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Tor4aQ8BH02 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tor4aQ8BH02 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tor4aQ8BH02 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tor4aQ8BH02 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tor4aQ8BH02 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tor4aQ8BH02 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tor4aQ8BH02 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tor4aQ8BH02 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tor4aQ8BH02 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tor4aQ8BH02 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Tor4aQ8BH02 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tor4aQ8BH02 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tor4aQ8BH02 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tor4aQ8BH02 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tor4aQ8BH02 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tor4aQ8BH02 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tor4aQ8BH02 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tor4aQ8BH02 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tor4aQ8BH02 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tor4aQ8BH02 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tor4aQ8BH02 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tor4aQ8BH02 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tor4aQ8BH02 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tor4aQ8BH02 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tor4aQ8BH02 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tor4aQ8BH02 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tor4aQ8BH02 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tor4aQ8BH02 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tor4aQ8BH02 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tor4aQ8BH02 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tor4aQ8BH02 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tor4aQ8BH02 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tor4aQ8BH02 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tor4aQ8BH02 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tor4aQ8BH02 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Tor4aQ8BH02 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tor4aQ8BH02 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tor4aQ8BH02 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tor4aQ8BH02 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tor4aQ8BH02 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tor4aQ8BH02 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tor4aQ8BH02 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tor4aQ8BH02 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tor4aQ8BH02 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tor4aQ8BH02 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tor4aQ8BH02 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Tor4aQ8BH02 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tor4aQ8BH02 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tor4aQ8BH02 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tor4aQ8BH02 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tor4aQ8BH02 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tor4aQ8BH02 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Tor4aQ8BH02 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tor4aQ8BH02 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tor4aQ8BH02 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tor4aQ8BH02 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tor4aQ8BH02 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tor4aQ8BH02 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tor4aQ8BH02 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tor4aQ8BH02 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Tor4aQ8BH02 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tor4aQ8BH02 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tor4aQ8BH02 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tor4aQ8BH02 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tor4aQ8BH02 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tor4aQ8BH02 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tor4aQ8BH02 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tor4aQ8BH02 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tor4aQ8BH02 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Tor4aQ8BH02 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tor4aQ8BH02 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tor4aQ8BH02 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms