Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cyp4f39Q8BGU0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cyp4f39Q8BGU0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cyp4f39Q8BGU0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cyp4f39Q8BGU0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cyp4f39Q8BGU0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cyp4f39Q8BGU0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cyp4f39Q8BGU0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cyp4f39Q8BGU0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cyp4f39Q8BGU0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cyp4f39Q8BGU0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cyp4f39Q8BGU0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cyp4f39Q8BGU0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cyp4f39Q8BGU0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cyp4f39Q8BGU0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cyp4f39Q8BGU0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cyp4f39Q8BGU0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cyp4f39Q8BGU0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Cyp4f39Q8BGU0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cyp4f39Q8BGU0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cyp4f39Q8BGU0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cyp4f39Q8BGU0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cyp4f39Q8BGU0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cyp4f39Q8BGU0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cyp4f39Q8BGU0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Cyp4f39Q8BGU0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cyp4f39Q8BGU0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cyp4f39Q8BGU0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Cyp4f39Q8BGU0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cyp4f39Q8BGU0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cyp4f39Q8BGU0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Cyp4f39Q8BGU0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cyp4f39Q8BGU0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cyp4f39Q8BGU0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cyp4f39Q8BGU0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cyp4f39Q8BGU0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cyp4f39Q8BGU0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cyp4f39Q8BGU0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cyp4f39Q8BGU0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cyp4f39Q8BGU0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cyp4f39Q8BGU0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cyp4f39Q8BGU0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cyp4f39Q8BGU0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cyp4f39Q8BGU0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cyp4f39Q8BGU0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Cyp4f39Q8BGU0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cyp4f39Q8BGU0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cyp4f39Q8BGU0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cyp4f39Q8BGU0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Cyp4f39Q8BGU0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cyp4f39Q8BGU0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cyp4f39Q8BGU0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cyp4f39Q8BGU0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cyp4f39Q8BGU0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cyp4f39Q8BGU0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cyp4f39Q8BGU0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cyp4f39Q8BGU0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cyp4f39Q8BGU0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cyp4f39Q8BGU0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cyp4f39Q8BGU0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cyp4f39Q8BGU0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Cyp4f39Q8BGU0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Cyp4f39Q8BGU0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cyp4f39Q8BGU0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cyp4f39Q8BGU0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cyp4f39Q8BGU0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cyp4f39Q8BGU0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cyp4f39Q8BGU0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cyp4f39Q8BGU0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cyp4f39Q8BGU0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cyp4f39Q8BGU0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cyp4f39Q8BGU0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cyp4f39Q8BGU0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cyp4f39Q8BGU0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cyp4f39Q8BGU0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cyp4f39Q8BGU0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cyp4f39Q8BGU0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cyp4f39Q8BGU0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms