Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZF2

Ifne, Interferon epsilon, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfneQ80ZF2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IfneQ80ZF2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IfneQ80ZF2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IfneQ80ZF2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IfneQ80ZF2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IfneQ80ZF2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IfneQ80ZF2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IfneQ80ZF2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IfneQ80ZF2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IfneQ80ZF2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IfneQ80ZF2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IfneQ80ZF2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IfneQ80ZF2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IfneQ80ZF2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IfneQ80ZF2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IfneQ80ZF2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IfneQ80ZF2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IfneQ80ZF2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IfneQ80ZF2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IfneQ80ZF2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IfneQ80ZF2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IfneQ80ZF2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IfneQ80ZF2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IfneQ80ZF2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IfneQ80ZF2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IfneQ80ZF2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IfneQ80ZF2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
IfneQ80ZF2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IfneQ80ZF2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IfneQ80ZF2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IfneQ80ZF2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IfneQ80ZF2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IfneQ80ZF2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IfneQ80ZF2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IfneQ80ZF2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IfneQ80ZF2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IfneQ80ZF2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IfneQ80ZF2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IfneQ80ZF2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IfneQ80ZF2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IfneQ80ZF2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IfneQ80ZF2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IfneQ80ZF2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IfneQ80ZF2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IfneQ80ZF2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IfneQ80ZF2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IfneQ80ZF2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IfneQ80ZF2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IfneQ80ZF2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IfneQ80ZF2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IfneQ80ZF2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IfneQ80ZF2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IfneQ80ZF2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IfneQ80ZF2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IfneQ80ZF2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IfneQ80ZF2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IfneQ80ZF2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IfneQ80ZF2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IfneQ80ZF2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IfneQ80ZF2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IfneQ80ZF2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IfneQ80ZF2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IfneQ80ZF2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IfneQ80ZF2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IfneQ80ZF2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IfneQ80ZF2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IfneQ80ZF2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IfneQ80ZF2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IfneQ80ZF2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IfneQ80ZF2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IfneQ80ZF2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IfneQ80ZF2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IfneQ80ZF2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
IfneQ80ZF2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IfneQ80ZF2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IfneQ80ZF2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
IfneQ80ZF2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IfneQ80ZF2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IfneQ80ZF2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IfneQ80ZF2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IfneQ80ZF2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IfneQ80ZF2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IfneQ80ZF2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
IfneQ80ZF2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IfneQ80ZF2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IfneQ80ZF2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IfneQ80ZF2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IfneQ80ZF2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IfneQ80ZF2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IfneQ80ZF2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IfneQ80ZF2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IfneQ80ZF2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IfneQ80ZF2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IfneQ80ZF2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IfneQ80ZF2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IfneQ80ZF2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IfneQ80ZF2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IfneQ80ZF2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IfneQ80ZF2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IfneQ80ZF2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms