Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS9

Stkld1, Serine/threonine kinase-like domain-containing protein STKLD1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stkld1Q80YS9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Stkld1Q80YS9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Stkld1Q80YS9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Stkld1Q80YS9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Stkld1Q80YS9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Stkld1Q80YS9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Stkld1Q80YS9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Stkld1Q80YS9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Stkld1Q80YS9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Stkld1Q80YS9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Stkld1Q80YS9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stkld1Q80YS9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Stkld1Q80YS9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Stkld1Q80YS9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Stkld1Q80YS9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Stkld1Q80YS9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Stkld1Q80YS9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Stkld1Q80YS9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Stkld1Q80YS9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Stkld1Q80YS9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stkld1Q80YS9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Stkld1Q80YS9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Stkld1Q80YS9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Stkld1Q80YS9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Stkld1Q80YS9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Stkld1Q80YS9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Stkld1Q80YS9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Stkld1Q80YS9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Stkld1Q80YS9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stkld1Q80YS9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Stkld1Q80YS9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stkld1Q80YS9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stkld1Q80YS9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Stkld1Q80YS9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stkld1Q80YS9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Stkld1Q80YS9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Stkld1Q80YS9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Stkld1Q80YS9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stkld1Q80YS9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stkld1Q80YS9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Stkld1Q80YS9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stkld1Q80YS9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stkld1Q80YS9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stkld1Q80YS9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stkld1Q80YS9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stkld1Q80YS9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stkld1Q80YS9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stkld1Q80YS9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stkld1Q80YS9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stkld1Q80YS9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stkld1Q80YS9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stkld1Q80YS9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stkld1Q80YS9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stkld1Q80YS9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stkld1Q80YS9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stkld1Q80YS9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stkld1Q80YS9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stkld1Q80YS9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Stkld1Q80YS9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Stkld1Q80YS9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Stkld1Q80YS9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stkld1Q80YS9 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Stkld1Q80YS9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stkld1Q80YS9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stkld1Q80YS9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stkld1Q80YS9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Stkld1Q80YS9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stkld1Q80YS9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stkld1Q80YS9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Stkld1Q80YS9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stkld1Q80YS9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Stkld1Q80YS9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Stkld1Q80YS9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Stkld1Q80YS9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Stkld1Q80YS9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Stkld1Q80YS9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Stkld1Q80YS9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Stkld1Q80YS9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Stkld1Q80YS9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stkld1Q80YS9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Stkld1Q80YS9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Stkld1Q80YS9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stkld1Q80YS9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Stkld1Q80YS9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Stkld1Q80YS9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stkld1Q80YS9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stkld1Q80YS9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stkld1Q80YS9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Stkld1Q80YS9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Stkld1Q80YS9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Stkld1Q80YS9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Stkld1Q80YS9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stkld1Q80YS9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Stkld1Q80YS9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stkld1Q80YS9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stkld1Q80YS9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Stkld1Q80YS9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Stkld1Q80YS9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Stkld1Q80YS9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Stkld1Q80YS9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms