Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y56

Rbsn, Rabenosyn-5, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbsnQ80Y56 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RbsnQ80Y56 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RbsnQ80Y56 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RbsnQ80Y56 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RbsnQ80Y56 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RbsnQ80Y56 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RbsnQ80Y56 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RbsnQ80Y56 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RbsnQ80Y56 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RbsnQ80Y56 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RbsnQ80Y56 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RbsnQ80Y56 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RbsnQ80Y56 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RbsnQ80Y56 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
RbsnQ80Y56 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RbsnQ80Y56 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RbsnQ80Y56 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RbsnQ80Y56 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RbsnQ80Y56 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RbsnQ80Y56 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RbsnQ80Y56 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RbsnQ80Y56 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RbsnQ80Y56 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RbsnQ80Y56 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RbsnQ80Y56 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RbsnQ80Y56 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RbsnQ80Y56 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RbsnQ80Y56 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RbsnQ80Y56 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RbsnQ80Y56 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RbsnQ80Y56 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RbsnQ80Y56 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RbsnQ80Y56 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RbsnQ80Y56 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RbsnQ80Y56 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RbsnQ80Y56 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RbsnQ80Y56 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RbsnQ80Y56 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RbsnQ80Y56 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RbsnQ80Y56 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RbsnQ80Y56 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RbsnQ80Y56 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RbsnQ80Y56 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RbsnQ80Y56 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RbsnQ80Y56 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RbsnQ80Y56 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RbsnQ80Y56 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RbsnQ80Y56 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RbsnQ80Y56 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RbsnQ80Y56 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RbsnQ80Y56 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RbsnQ80Y56 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RbsnQ80Y56 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RbsnQ80Y56 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RbsnQ80Y56 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RbsnQ80Y56 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RbsnQ80Y56 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RbsnQ80Y56 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RbsnQ80Y56 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RbsnQ80Y56 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RbsnQ80Y56 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RbsnQ80Y56 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RbsnQ80Y56 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RbsnQ80Y56 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RbsnQ80Y56 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RbsnQ80Y56 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RbsnQ80Y56 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RbsnQ80Y56 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RbsnQ80Y56 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RbsnQ80Y56 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RbsnQ80Y56 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RbsnQ80Y56 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RbsnQ80Y56 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RbsnQ80Y56 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RbsnQ80Y56 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RbsnQ80Y56 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RbsnQ80Y56 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RbsnQ80Y56 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RbsnQ80Y56 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RbsnQ80Y56 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RbsnQ80Y56 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RbsnQ80Y56 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RbsnQ80Y56 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RbsnQ80Y56 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RbsnQ80Y56 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RbsnQ80Y56 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RbsnQ80Y56 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RbsnQ80Y56 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RbsnQ80Y56 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RbsnQ80Y56 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RbsnQ80Y56 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RbsnQ80Y56 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RbsnQ80Y56 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RbsnQ80Y56 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RbsnQ80Y56 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RbsnQ80Y56 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RbsnQ80Y56 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RbsnQ80Y56 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RbsnQ80Y56 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RbsnQ80Y56 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms