Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clec4b1Q7TS58 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Clec4b1Q7TS58 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Clec4b1Q7TS58 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clec4b1Q7TS58 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clec4b1Q7TS58 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clec4b1Q7TS58 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clec4b1Q7TS58 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clec4b1Q7TS58 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clec4b1Q7TS58 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clec4b1Q7TS58 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clec4b1Q7TS58 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clec4b1Q7TS58 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clec4b1Q7TS58 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clec4b1Q7TS58 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clec4b1Q7TS58 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clec4b1Q7TS58 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clec4b1Q7TS58 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clec4b1Q7TS58 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clec4b1Q7TS58 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clec4b1Q7TS58 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clec4b1Q7TS58 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clec4b1Q7TS58 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clec4b1Q7TS58 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Clec4b1Q7TS58 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clec4b1Q7TS58 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Clec4b1Q7TS58 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clec4b1Q7TS58 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clec4b1Q7TS58 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clec4b1Q7TS58 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clec4b1Q7TS58 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clec4b1Q7TS58 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clec4b1Q7TS58 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clec4b1Q7TS58 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clec4b1Q7TS58 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clec4b1Q7TS58 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clec4b1Q7TS58 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clec4b1Q7TS58 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clec4b1Q7TS58 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clec4b1Q7TS58 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clec4b1Q7TS58 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clec4b1Q7TS58 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clec4b1Q7TS58 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clec4b1Q7TS58 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clec4b1Q7TS58 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clec4b1Q7TS58 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clec4b1Q7TS58 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clec4b1Q7TS58 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Clec4b1Q7TS58 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clec4b1Q7TS58 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clec4b1Q7TS58 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clec4b1Q7TS58 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clec4b1Q7TS58 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clec4b1Q7TS58 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clec4b1Q7TS58 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clec4b1Q7TS58 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Clec4b1Q7TS58 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clec4b1Q7TS58 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clec4b1Q7TS58 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clec4b1Q7TS58 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clec4b1Q7TS58 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clec4b1Q7TS58 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clec4b1Q7TS58 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Clec4b1Q7TS58 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clec4b1Q7TS58 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clec4b1Q7TS58 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Clec4b1Q7TS58 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clec4b1Q7TS58 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clec4b1Q7TS58 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Clec4b1Q7TS58 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clec4b1Q7TS58 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Clec4b1Q7TS58 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clec4b1Q7TS58 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clec4b1Q7TS58 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Clec4b1Q7TS58 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clec4b1Q7TS58 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Clec4b1Q7TS58 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Clec4b1Q7TS58 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clec4b1Q7TS58 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clec4b1Q7TS58 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Clec4b1Q7TS58 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clec4b1Q7TS58 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clec4b1Q7TS58 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clec4b1Q7TS58 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clec4b1Q7TS58 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clec4b1Q7TS58 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clec4b1Q7TS58 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clec4b1Q7TS58 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clec4b1Q7TS58 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clec4b1Q7TS58 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clec4b1Q7TS58 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clec4b1Q7TS58 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clec4b1Q7TS58 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clec4b1Q7TS58 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clec4b1Q7TS58 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Clec4b1Q7TS58 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clec4b1Q7TS58 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clec4b1Q7TS58 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clec4b1Q7TS58 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clec4b1Q7TS58 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms