Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rph3alQ768S4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rph3alQ768S4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rph3alQ768S4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rph3alQ768S4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rph3alQ768S4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rph3alQ768S4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rph3alQ768S4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rph3alQ768S4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rph3alQ768S4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rph3alQ768S4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rph3alQ768S4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rph3alQ768S4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rph3alQ768S4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rph3alQ768S4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rph3alQ768S4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rph3alQ768S4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rph3alQ768S4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rph3alQ768S4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rph3alQ768S4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rph3alQ768S4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rph3alQ768S4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rph3alQ768S4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rph3alQ768S4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rph3alQ768S4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rph3alQ768S4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rph3alQ768S4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rph3alQ768S4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rph3alQ768S4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rph3alQ768S4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rph3alQ768S4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rph3alQ768S4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rph3alQ768S4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rph3alQ768S4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rph3alQ768S4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rph3alQ768S4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rph3alQ768S4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rph3alQ768S4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rph3alQ768S4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rph3alQ768S4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rph3alQ768S4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rph3alQ768S4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rph3alQ768S4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rph3alQ768S4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rph3alQ768S4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rph3alQ768S4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rph3alQ768S4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rph3alQ768S4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rph3alQ768S4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rph3alQ768S4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rph3alQ768S4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rph3alQ768S4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rph3alQ768S4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rph3alQ768S4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rph3alQ768S4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rph3alQ768S4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rph3alQ768S4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rph3alQ768S4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rph3alQ768S4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rph3alQ768S4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rph3alQ768S4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rph3alQ768S4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rph3alQ768S4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rph3alQ768S4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rph3alQ768S4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rph3alQ768S4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rph3alQ768S4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rph3alQ768S4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rph3alQ768S4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rph3alQ768S4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rph3alQ768S4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rph3alQ768S4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rph3alQ768S4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rph3alQ768S4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rph3alQ768S4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rph3alQ768S4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rph3alQ768S4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rph3alQ768S4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rph3alQ768S4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rph3alQ768S4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rph3alQ768S4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rph3alQ768S4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rph3alQ768S4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rph3alQ768S4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rph3alQ768S4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rph3alQ768S4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rph3alQ768S4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rph3alQ768S4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rph3alQ768S4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rph3alQ768S4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rph3alQ768S4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rph3alQ768S4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rph3alQ768S4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rph3alQ768S4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rph3alQ768S4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rph3alQ768S4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rph3alQ768S4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rph3alQ768S4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rph3alQ768S4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rph3alQ768S4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms