Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

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Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
NinlQ6ZQ12 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36,87■■■■□ 3,49
NinlQ6ZQ12 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,86■■■■□ 3,49
NinlQ6ZQ12 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC36,85■■■■□ 3,49
NinlQ6ZQ12 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,84■■■■□ 3,49
NinlQ6ZQ12 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC36,83■■■■□ 3,49
NinlQ6ZQ12 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,82■■■■□ 3,48
NinlQ6ZQ12 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC36,81■■■■□ 3,48
NinlQ6ZQ12 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
NinlQ6ZQ12 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,76■■■■□ 3,48
NinlQ6ZQ12 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,76■■■■□ 3,48
NinlQ6ZQ12 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC36,74■■■■□ 3,47
NinlQ6ZQ12 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
NinlQ6ZQ12 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC36,73■■■■□ 3,47
NinlQ6ZQ12 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,7■■■■□ 3,47
NinlQ6ZQ12 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36,68■■■■□ 3,46
NinlQ6ZQ12 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,64■■■■□ 3,46
NinlQ6ZQ12 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,63■■■■□ 3,45
NinlQ6ZQ12 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,62■■■■□ 3,45
NinlQ6ZQ12 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,61■■■■□ 3,45
NinlQ6ZQ12 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC36,61■■■■□ 3,45
NinlQ6ZQ12 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36,61■■■■□ 3,45
NinlQ6ZQ12 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
NinlQ6ZQ12 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,59■■■■□ 3,45
NinlQ6ZQ12 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,56■■■■□ 3,44
NinlQ6ZQ12 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36,55■■■■□ 3,44
NinlQ6ZQ12 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC36,54■■■■□ 3,44
NinlQ6ZQ12 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,51■■■■□ 3,44
NinlQ6ZQ12 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,51■■■■□ 3,44
NinlQ6ZQ12 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC36,5■■■■□ 3,43
NinlQ6ZQ12 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC36,47■■■■□ 3,43
NinlQ6ZQ12 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC36,47■■■■□ 3,43
NinlQ6ZQ12 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,46■■■■□ 3,43
NinlQ6ZQ12 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,43
NinlQ6ZQ12 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,44■■■■□ 3,42
NinlQ6ZQ12 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,44■■■■□ 3,42
NinlQ6ZQ12 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,42■■■■□ 3,42
NinlQ6ZQ12 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC36,4■■■■□ 3,42
NinlQ6ZQ12 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,38■■■■□ 3,41
NinlQ6ZQ12 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
NinlQ6ZQ12 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC36,35■■■■□ 3,41
NinlQ6ZQ12 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
NinlQ6ZQ12 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC36,33■■■■□ 3,41
NinlQ6ZQ12 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,41
NinlQ6ZQ12 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,4
NinlQ6ZQ12 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,31■■■■□ 3,4
NinlQ6ZQ12 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
NinlQ6ZQ12 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC36,29■■■■□ 3,4
NinlQ6ZQ12 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC36,27■■■■□ 3,4
NinlQ6ZQ12 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC36,26■■■■□ 3,39
NinlQ6ZQ12 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36,22■■■■□ 3,39
NinlQ6ZQ12 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36,21■■■■□ 3,39
NinlQ6ZQ12 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,2■■■■□ 3,39
NinlQ6ZQ12 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
NinlQ6ZQ12 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC36,18■■■■□ 3,38
NinlQ6ZQ12 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
NinlQ6ZQ12 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
NinlQ6ZQ12 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
NinlQ6ZQ12 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,16■■■■□ 3,38
NinlQ6ZQ12 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36,12■■■■□ 3,37
NinlQ6ZQ12 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
NinlQ6ZQ12 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,1■■■■□ 3,37
NinlQ6ZQ12 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
NinlQ6ZQ12 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC36,09■■■■□ 3,37
NinlQ6ZQ12 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC36,08■■■■□ 3,37
NinlQ6ZQ12 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC36,07■■■■□ 3,36
NinlQ6ZQ12 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC36,05■■■■□ 3,36
NinlQ6ZQ12 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
NinlQ6ZQ12 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,35
NinlQ6ZQ12 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
NinlQ6ZQ12 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
NinlQ6ZQ12 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC35,97■■■■□ 3,35
NinlQ6ZQ12 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
NinlQ6ZQ12 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC35,95■■■■□ 3,35
NinlQ6ZQ12 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
NinlQ6ZQ12 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC35,94■■■■□ 3,34
NinlQ6ZQ12 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
NinlQ6ZQ12 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
NinlQ6ZQ12 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
NinlQ6ZQ12 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC35,86■■■■□ 3,33
NinlQ6ZQ12 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC35,86■■■■□ 3,33
NinlQ6ZQ12 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC35,85■■■■□ 3,33
NinlQ6ZQ12 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC35,85■■■■□ 3,33
NinlQ6ZQ12 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,85■■■■□ 3,33
NinlQ6ZQ12 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,82■■■■□ 3,33
NinlQ6ZQ12 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
NinlQ6ZQ12 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
NinlQ6ZQ12 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC35,79■■■■□ 3,32
NinlQ6ZQ12 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
NinlQ6ZQ12 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
NinlQ6ZQ12 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
NinlQ6ZQ12 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,72■■■■□ 3,31
NinlQ6ZQ12 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
NinlQ6ZQ12 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC35,68■■■■□ 3,3
NinlQ6ZQ12 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
NinlQ6ZQ12 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC35,66■■■■□ 3,3
NinlQ6ZQ12 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,62■■■■□ 3,29
NinlQ6ZQ12 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC35,61■■■■□ 3,29
NinlQ6ZQ12 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC35,59■■■■□ 3,29
NinlQ6ZQ12 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
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