Protein–RNA interactions for Protein: Q6XQH0

Gal3st2, Galactose-3-O-sulfotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gal3st2Q6XQH0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gal3st2Q6XQH0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gal3st2Q6XQH0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gal3st2Q6XQH0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gal3st2Q6XQH0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gal3st2Q6XQH0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gal3st2Q6XQH0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gal3st2Q6XQH0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gal3st2Q6XQH0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gal3st2Q6XQH0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gal3st2Q6XQH0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gal3st2Q6XQH0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gal3st2Q6XQH0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gal3st2Q6XQH0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gal3st2Q6XQH0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gal3st2Q6XQH0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gal3st2Q6XQH0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gal3st2Q6XQH0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gal3st2Q6XQH0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gal3st2Q6XQH0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gal3st2Q6XQH0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gal3st2Q6XQH0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gal3st2Q6XQH0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gal3st2Q6XQH0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gal3st2Q6XQH0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gal3st2Q6XQH0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gal3st2Q6XQH0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gal3st2Q6XQH0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gal3st2Q6XQH0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gal3st2Q6XQH0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gal3st2Q6XQH0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gal3st2Q6XQH0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gal3st2Q6XQH0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gal3st2Q6XQH0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gal3st2Q6XQH0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gal3st2Q6XQH0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gal3st2Q6XQH0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gal3st2Q6XQH0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gal3st2Q6XQH0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gal3st2Q6XQH0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gal3st2Q6XQH0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Gal3st2Q6XQH0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gal3st2Q6XQH0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gal3st2Q6XQH0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gal3st2Q6XQH0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gal3st2Q6XQH0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gal3st2Q6XQH0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gal3st2Q6XQH0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gal3st2Q6XQH0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gal3st2Q6XQH0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gal3st2Q6XQH0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gal3st2Q6XQH0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Gal3st2Q6XQH0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gal3st2Q6XQH0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gal3st2Q6XQH0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gal3st2Q6XQH0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gal3st2Q6XQH0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gal3st2Q6XQH0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gal3st2Q6XQH0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gal3st2Q6XQH0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gal3st2Q6XQH0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gal3st2Q6XQH0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gal3st2Q6XQH0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gal3st2Q6XQH0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gal3st2Q6XQH0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gal3st2Q6XQH0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gal3st2Q6XQH0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gal3st2Q6XQH0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gal3st2Q6XQH0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gal3st2Q6XQH0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gal3st2Q6XQH0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gal3st2Q6XQH0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gal3st2Q6XQH0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gal3st2Q6XQH0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gal3st2Q6XQH0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gal3st2Q6XQH0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gal3st2Q6XQH0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gal3st2Q6XQH0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gal3st2Q6XQH0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gal3st2Q6XQH0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gal3st2Q6XQH0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gal3st2Q6XQH0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gal3st2Q6XQH0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gal3st2Q6XQH0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gal3st2Q6XQH0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gal3st2Q6XQH0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gal3st2Q6XQH0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gal3st2Q6XQH0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gal3st2Q6XQH0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gal3st2Q6XQH0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gal3st2Q6XQH0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gal3st2Q6XQH0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gal3st2Q6XQH0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gal3st2Q6XQH0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gal3st2Q6XQH0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gal3st2Q6XQH0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gal3st2Q6XQH0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gal3st2Q6XQH0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gal3st2Q6XQH0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gal3st2Q6XQH0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms