Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Smchd1Q6P5D8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Smchd1Q6P5D8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Smchd1Q6P5D8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Smchd1Q6P5D8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Smchd1Q6P5D8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Smchd1Q6P5D8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Smchd1Q6P5D8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smchd1Q6P5D8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Smchd1Q6P5D8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Smchd1Q6P5D8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Smchd1Q6P5D8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Smchd1Q6P5D8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Smchd1Q6P5D8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Smchd1Q6P5D8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Smchd1Q6P5D8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Smchd1Q6P5D8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Smchd1Q6P5D8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smchd1Q6P5D8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smchd1Q6P5D8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smchd1Q6P5D8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smchd1Q6P5D8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smchd1Q6P5D8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smchd1Q6P5D8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smchd1Q6P5D8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Smchd1Q6P5D8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Smchd1Q6P5D8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Smchd1Q6P5D8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Smchd1Q6P5D8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Smchd1Q6P5D8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Smchd1Q6P5D8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Smchd1Q6P5D8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smchd1Q6P5D8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smchd1Q6P5D8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Smchd1Q6P5D8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Smchd1Q6P5D8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smchd1Q6P5D8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smchd1Q6P5D8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Smchd1Q6P5D8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Smchd1Q6P5D8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Smchd1Q6P5D8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Smchd1Q6P5D8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Smchd1Q6P5D8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Smchd1Q6P5D8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Smchd1Q6P5D8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Smchd1Q6P5D8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Smchd1Q6P5D8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Smchd1Q6P5D8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Smchd1Q6P5D8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Smchd1Q6P5D8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smchd1Q6P5D8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Smchd1Q6P5D8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Smchd1Q6P5D8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Smchd1Q6P5D8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smchd1Q6P5D8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smchd1Q6P5D8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Smchd1Q6P5D8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smchd1Q6P5D8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Smchd1Q6P5D8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Smchd1Q6P5D8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Smchd1Q6P5D8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Smchd1Q6P5D8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Smchd1Q6P5D8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smchd1Q6P5D8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smchd1Q6P5D8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smchd1Q6P5D8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smchd1Q6P5D8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smchd1Q6P5D8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smchd1Q6P5D8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smchd1Q6P5D8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Smchd1Q6P5D8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smchd1Q6P5D8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Smchd1Q6P5D8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Smchd1Q6P5D8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smchd1Q6P5D8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Smchd1Q6P5D8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smchd1Q6P5D8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smchd1Q6P5D8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smchd1Q6P5D8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smchd1Q6P5D8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smchd1Q6P5D8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smchd1Q6P5D8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smchd1Q6P5D8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smchd1Q6P5D8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smchd1Q6P5D8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smchd1Q6P5D8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smchd1Q6P5D8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Smchd1Q6P5D8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Smchd1Q6P5D8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Smchd1Q6P5D8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Smchd1Q6P5D8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Smchd1Q6P5D8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Smchd1Q6P5D8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smchd1Q6P5D8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Smchd1Q6P5D8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smchd1Q6P5D8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Smchd1Q6P5D8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smchd1Q6P5D8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Smchd1Q6P5D8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Smchd1Q6P5D8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms