Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF0

Ocrl, Inositol polyphosphate 5-phosphatase OCRL-1, mousemouse

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OcrlQ6NVF0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
OcrlQ6NVF0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
OcrlQ6NVF0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
OcrlQ6NVF0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
OcrlQ6NVF0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
OcrlQ6NVF0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
OcrlQ6NVF0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.57■■■□□ 2
OcrlQ6NVF0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
OcrlQ6NVF0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
OcrlQ6NVF0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
OcrlQ6NVF0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
OcrlQ6NVF0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
OcrlQ6NVF0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
OcrlQ6NVF0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
OcrlQ6NVF0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
OcrlQ6NVF0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
OcrlQ6NVF0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
OcrlQ6NVF0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
OcrlQ6NVF0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
OcrlQ6NVF0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
OcrlQ6NVF0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
OcrlQ6NVF0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
OcrlQ6NVF0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
OcrlQ6NVF0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OcrlQ6NVF0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
OcrlQ6NVF0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
OcrlQ6NVF0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
OcrlQ6NVF0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
OcrlQ6NVF0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
OcrlQ6NVF0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
OcrlQ6NVF0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
OcrlQ6NVF0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
OcrlQ6NVF0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
OcrlQ6NVF0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
OcrlQ6NVF0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
OcrlQ6NVF0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
OcrlQ6NVF0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
OcrlQ6NVF0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
OcrlQ6NVF0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
OcrlQ6NVF0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
OcrlQ6NVF0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
OcrlQ6NVF0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
OcrlQ6NVF0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
OcrlQ6NVF0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
OcrlQ6NVF0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
OcrlQ6NVF0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
OcrlQ6NVF0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
OcrlQ6NVF0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
OcrlQ6NVF0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
OcrlQ6NVF0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
OcrlQ6NVF0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
OcrlQ6NVF0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
OcrlQ6NVF0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
OcrlQ6NVF0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
OcrlQ6NVF0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
OcrlQ6NVF0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
OcrlQ6NVF0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
OcrlQ6NVF0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
OcrlQ6NVF0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OcrlQ6NVF0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
OcrlQ6NVF0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
OcrlQ6NVF0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
OcrlQ6NVF0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
OcrlQ6NVF0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
OcrlQ6NVF0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
OcrlQ6NVF0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
OcrlQ6NVF0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
OcrlQ6NVF0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
OcrlQ6NVF0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
OcrlQ6NVF0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
OcrlQ6NVF0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
OcrlQ6NVF0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
OcrlQ6NVF0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
OcrlQ6NVF0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
OcrlQ6NVF0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
OcrlQ6NVF0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OcrlQ6NVF0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OcrlQ6NVF0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OcrlQ6NVF0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
OcrlQ6NVF0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
OcrlQ6NVF0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
OcrlQ6NVF0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
OcrlQ6NVF0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
OcrlQ6NVF0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
OcrlQ6NVF0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
OcrlQ6NVF0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
OcrlQ6NVF0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OcrlQ6NVF0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
OcrlQ6NVF0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
OcrlQ6NVF0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
OcrlQ6NVF0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
OcrlQ6NVF0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
OcrlQ6NVF0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OcrlQ6NVF0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
OcrlQ6NVF0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
OcrlQ6NVF0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
OcrlQ6NVF0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
OcrlQ6NVF0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
OcrlQ6NVF0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
OcrlQ6NVF0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms